Sökning: id:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:152292763" >
Deep thermal profil...
Deep thermal profiling for detection of functional proteoform groups
-
Kurzawa, N (författare)
-
- Leo, IR (författare)
- Karolinska Institutet
-
Stahl, M (författare)
-
visa fler...
-
Kunold, E (författare)
-
Becher, I (författare)
-
Audrey, A (författare)
-
Mermelekas, G (författare)
-
Huber, W (författare)
-
Mateus, A (författare)
-
Savitski, MM (författare)
-
- Jafari, R (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2023-03-20
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Nature chemical biology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1552-4469 .- 1552-4450. ; 19:8, s. 962-
- Relaterad länk:
-
http://kipublication...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The complexity of the functional proteome extends considerably beyond the coding genome, resulting in millions of proteoforms. Investigation of proteoforms and their functional roles is important to understand cellular physiology and its deregulation in diseases but challenging to perform systematically. Here we applied thermal proteome profiling with deep peptide coverage to detect functional proteoform groups in acute lymphoblastic leukemia cell lines with different cytogenetic aberrations. We detected 15,846 proteoforms, capturing differently spliced, cleaved and post-translationally modified proteins expressed from 9,290 genes. We identified differential co-aggregation of proteoform pairs and established links to disease biology. Moreover, we systematically made use of measured biophysical proteoform states to find specific biomarkers of drug sensitivity. Our approach, thus, provides a powerful and unique tool for systematic detection and functional annotation of proteoform groups.
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kurzawa, N
-
Leo, IR
-
Stahl, M
-
Kunold, E
-
Becher, I
-
Audrey, A
-
visa fler...
-
Mermelekas, G
-
Huber, W
-
Mateus, A
-
Savitski, MM
-
Jafari, R
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nature chemical ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet