Sökning: id:"swepub:oai:research.chalmers.se:29a1ac0d-53de-4705-a73a-0fbe0ac5a052" >
Modeling glioblasto...
Modeling glioblastoma heterogeneity as a dynamic network of cell states
-
- Larsson, Ida (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Dalmo, Erika (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.
-
- Elgendy, Ramy (författare)
- Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.
-
visa fler...
-
- Niklasson, Mia (författare)
- Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.
-
- Doroszko, Milena (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.
-
- Segerman, Anna (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.;Uppsala Univ Hosp, Dept Med Sci Canc Pharmacol & Computat Med, Uppsala, Sweden.
-
- Jörnsten, Rebecka, 1971 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Math Sci, Gothenburg, Sweden.
-
- Westermark, Bengt (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi
-
- Nelander, Sven (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi
-
- Lundin, Erika (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala Univ, Dept Immunol Genet & Pathol, Uppsala, Sweden.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-09-16
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular Systems Biology. - : EMBO. - 1744-4292. ; 17:9
- Relaterad länk:
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://onlinelibrar...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://research.cha...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Tumor cell heterogeneity is a crucial characteristic of malignant brain tumors and underpins phenomena such as therapy resistance and tumor recurrence. Advances in single-cell analysis have enabled the delineation of distinct cellular states of brain tumor cells, but the time-dependent changes in such states remain poorly understood. Here, we construct quantitative models of the time-dependent transcriptional variation of patient-derived glioblastoma (GBM) cells. We build the models by sampling and profiling barcoded GBM cells and their progeny over the course of 3 weeks and by fitting a mathematical model to estimate changes in GBM cell states and their growth rates. Our model suggests a hierarchical yet plastic organization of GBM, where the rates and patterns of cell state switching are partly patient-specific. Therapeutic interventions produce complex dynamic effects, including inhibition of specific states and altered differentiation. Our method provides a general strategy to uncover time-dependent changes in cancer cells and offers a way to evaluate and predict how therapy affects cell state composition.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
Nyckelord
- cell state
- patient-derived brain tumor cells
- single-cell lineage tracing
- time-dependent computational models
- cellular barcoding
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Larsson, Ida
-
Dalmo, Erika
-
Elgendy, Ramy
-
Niklasson, Mia
-
Doroszko, Milena
-
Segerman, Anna
-
visa fler...
-
Jörnsten, Rebeck ...
-
Westermark, Beng ...
-
Nelander, Sven
-
Lundin, Erika
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular System ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Uppsala universitet