Sökning: id:"swepub:oai:research.chalmers.se:3db518a2-0055-4f3a-8f5f-7d8487331c50" >
Shared Molecular Ta...
Shared Molecular Targets Confer Resistance over Short and Long Evolutionary Timescales
-
- Li, Jing (författare)
- Université Côte d'Azur,University of Côte d'Azur
-
- Vázquez-García, Ignacio (författare)
- Columbia University in the City of New York,University Of Cambridge
-
- Persson, Karl, 1988 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
visa fler...
-
- González, Asier (författare)
- Universität Basel,University of Basel
-
- Yue, Jia Xing (författare)
- Université Côte d'Azur,University of Côte d'Azur
-
- Barré, Benjamin P. (författare)
- Université Côte d'Azur,University of Côte d'Azur
-
- Hall, Michael N. (författare)
- Universität Basel,University of Basel
-
- Long, Anthony (författare)
- University of California at Irvine (UCI)
-
- Warringer, Jonas, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Mustonen, Ville (författare)
- Helsingin Yliopisto,University of Helsinki
-
- Liti, Gianni (författare)
- Université Côte d'Azur,University of Côte d'Azur
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-01-17
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular Biology and Evolution. - : Oxford University Press (OUP). - 1537-1719 .- 0737-4038. ; 36:4, s. 691-708
- Relaterad länk:
-
https://europepmc.or...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Pre-existing and de novo genetic variants can both drive adaptation to environmental changes, but their relative contributions and interplay remain poorly understood. Here we investigated the evolutionary dynamics in drug-treated yeast populations with different levels of pre-existing variation by experimental evolution coupled with time-resolved sequencing and phenotyping. We found a doubling of pre-existing variation alone boosts the adaptation by 64.1% and 51.5% in hydroxyurea and rapamycin, respectively. The causative pre-existing and de novo variants were selected on shared targets: RNR4 in hydroxyurea and TOR1, TOR2 in rapamycin. Interestingly, the pre-existing and de novo TOR variants map to different functional domains and act via distinct mechanisms. The pre-existing TOR variants from two domesticated strains exhibited opposite rapamycin resistance effects, reflecting lineage-specific functional divergence. This study provides a dynamic view on how pre-existing and de novo variants interactively drive adaptation and deepens our understanding of clonally evolving populations.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- de novo mutation
- adaptation
- budding yeast
- drug resistance
- pre-existing genetic variation
- adaptation
- budding yeast
- de novo mutation
- drug resistance
- pre-existing genetic variation
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Li, Jing
-
Vázquez-García, ...
-
Persson, Karl, 1 ...
-
González, Asier
-
Yue, Jia Xing
-
Barré, Benjamin ...
-
visa fler...
-
Hall, Michael N.
-
Long, Anthony
-
Warringer, Jonas ...
-
Mustonen, Ville
-
Liti, Gianni
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Evolutionsbiolog ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
- Artiklar i publikationen
-
Molecular Biolog ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Göteborgs universitet