Sökning: id:"swepub:oai:research.chalmers.se:4228b655-9bd3-4d29-ad82-2551d608e12a" >
Greengenes, a Chime...
Greengenes, a Chimera-Checked 16S rRNA Gene Database and Workbench Compatible with ARB
-
DeSantis, T (författare)
-
Hugenholtz, P (författare)
-
Larsen, N (författare)
-
visa fler...
-
Rojas, M (författare)
-
Brodie, E (författare)
-
Keller, K (författare)
-
Huber, T (författare)
-
- Dalevi, Daniel, 1974 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
Andersen, G (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2006
- 2006
- Engelska.
-
Ingår i: AEM. ; 72, s. 5069-5072
- Relaterad länk:
-
https://research.cha...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- A 16S rRNA gene database (http://greengenes.lbl.gov) addresses limitations of public repositories by providing chimera screening, standard alignment, and taxonomic classification using multiple published taxonomies. It was found that there is incongruent taxonomic nomenclature among curators even at the phylum level. Putative chimeras were identified in 3% of environmental sequences and in 0.2% of records derived from isolates. Environmental sequences were classified into 100 phylum-level lineages in the Archaea and Bacteria.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
DeSantis, T
-
Hugenholtz, P
-
Larsen, N
-
Rojas, M
-
Brodie, E
-
Keller, K
-
visa fler...
-
Huber, T
-
Dalevi, Daniel, ...
-
Andersen, G
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
- AEM
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola