Multiplex detection of antibiotic resistance genes using padlock probes

Tyck till om SwePub Sök här!

Barisic, Ivan (författare)

Schoenthaler, Silvia (författare)

Ke, Rongqin (författare): Uppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Rudbeck Laboratory

Nilsson, Mats (författare): Uppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Molekylära verktyg,Rudbeck Laboratory

Noehammer, Christa (författare)

Wiesinger-Mayr, Herbert (författare)

(creator_code:org_t)

Elsevier BV, 2013
2013
Engelska.
Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease. - : Elsevier BV. - 0732-8893 .- 1879-0070. ; 77:2, s. 118-125

Relaterad länk:: https://urn.kb.se/re...; visa fler...; https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; visa färre...

Abstract Ämnesord

Stäng

The elucidation of resistance mechanisms is of central importance to providing and maintaining efficient medical treatment. However, molecular detection methods covering the complete set of resistance genes with a single test are still missing. Here, we present a novel 100-plex assay based on padlock probes in combination with a microarray that allows the simultaneous large-scale identification of highly diverse beta-lactamases. The specificity of the assay was performed using 70 clinical bacterial isolates, recovering 98% of the beta-lactamase nucleotide sequences present. Additionally, the sensitivity was evaluated with PCR products and genomic bacterial DNA, revealing a detection limit of 10(4) DNA copies per reaction when using PCR products as the template. Pre-amplification of genomic DNA in a 25-multiplex PCR further facilitated the detection of beta-lactamase genes in dilutions of 10(7) cells/mL. In summary, we present an efficient, highly specific, and highly sensitive multiplex detection method for any gene.

Av författaren/redakt...: Barisic, Ivan; Schoenthaler, Si ...; Ke, Rongqin; Nilsson, Mats; Noehammer, Chris ...; Wiesinger-Mayr, ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Infektionsmedici ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.