SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-395437"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-395437" > Genome-wide identif...

  • Huan, TianxiaoFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)

Genome-wide identification of DNA methylation QTLs in whole blood highlights pathways for cardiovascular disease

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-09-19
  • Springer Science and Business Media LLC,2019
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-395437
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-395437URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-019-12228-zDOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Identifying methylation quantitative trait loci (meQTLs) and integrating them with disease-associated variants from genome-wide association studies (GWAS) may illuminate functional mechanisms underlying genetic variant-disease associations. Here, we perform GWAS of >415 thousand CpG methylation sites in whole blood from 4170 individuals and map 4.7 million cis- and 630 thousand trans-meQTL variants targeting >120 thousand CpGs. Independent replication is performed in 1347 participants from two studies. By linking cis-meQTL variants with GWAS results for cardiovascular disease (CVD) traits, we identify 92 putatively causal CpGs for CVD traits by Mendelian randomization analysis. Further integrating gene expression data reveals evidence of cis CpG-transcript pairs causally linked to CVD. In addition, we identify 22 trans-meQTL hotspots each targeting more than 30 CpGs and find that trans-meQTL hotspots appear to act in cis on expression of nearby transcriptional regulatory genes. Our findings provide a powerful meQTL resource and shed light on DNA methylation involvement in human diseases.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Joehanes, RobyFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Song, CiUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Medicinsk genetik och genomik,Framingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, , Bethesda, MD USA(Swepub:uu)ciaso492 (författare)
  • Peng, FenUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, Inst Mol Med, Brown Fdn, McGovern Med Sch, Houston, TX USA (författare)
  • Guo, YichenHarvard Univ, Dept Environm Hlth, Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Boston, MA USA; Harvard Univ, Dept Biostat, Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Boston, MA USA (författare)
  • Mendelson, MichaelFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA; Harvard Univ, Dept Cardiol, Boston Childrens Hosp, Boston, MA USA (författare)
  • Yao, ChenFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Liu, ChunyuBoston Univ, Sch Publ Hlth, Dept Biostat, Boston, MA USA (författare)
  • Ma, JiantaoFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Richard, MelissaUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, Inst Mol Med, Brown Fdn, McGovern Med Sch, Houston, TX USA (författare)
  • Agha, GolarehColumbia Univ, Mailman Sch Publ Hlth, New York, NY USA (författare)
  • Guan, WeihuaUniv Minnesota, Sch Publ Hlth, Div Biostat, Minneapolis, MN USA (författare)
  • Almli, Lynn M.Emory Univ, Sch Med, Dept Psychiat & Behav Sci, Atlanta, GA USA (författare)
  • Conneely, Karen N.Emory Univ, Sch Med, Dept Human Genet, Atlanta, GA USA (författare)
  • Keefe, JoshuaFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Hwang, Shih-JenFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Johnson, Andrew D.Framingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Fornage, MyriamUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, Inst Mol Med, Brown Fdn, McGovern Med Sch, Houston, TX USA (författare)
  • Liang, LimingHarvard Univ, Dept Biostat, Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Boston, MA USA; Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Dept Epidemiol, Boston, MA USA (författare)
  • Leyy, DanielFramingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USA (författare)
  • Framingham Heart Dis Epidemiol Study, Framingham, MA USA; NHLBI, Populat Sci Branch, Div Intramural Res, NIH, Bethesda, MD USAMolekylär epidemiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC102041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy