SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Hawkins Michael Brent)
 

Sökning: WFRF:(Hawkins Michael Brent) > Grant Peter R. > Insights into the e...

  • Rands, Chris M. (författare)

Insights into the evolution of Darwin's finches from comparative analysis of the Geospiza magnirostris genome sequence

  • E-artikel/E-kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2013

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:22081512
  • http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-197069uri
  • urn:nbn:se:uu:diva-197069urn
  • 10.1186/1471-2164-14-95doi

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Anmärkningar

  • Published
  • gratis
  • Background: A classical example of repeated speciation coupled with ecological diversification is the evolution of 14 closely related species of Darwin's (Galapagos) finches (Thraupidae, Passeriformes). Their adaptive radiation in the Galapagos archipelago took place in the last 2-3 million years and some of the molecular mechanisms that led to their diversification are now being elucidated. Here we report evolutionary analyses of genome of the large ground finch, Geospiza magnirostris. Results: 13,291 protein-coding genes were predicted from a 991.0 Mb G. magnirostris genome assembly. We then defined gene orthology relationships and constructed whole genome alignments between the G. magnirostris and other vertebrate genomes. We estimate that 15% of genomic sequence is functionally constrained between G. magnirostris and zebra finch. Genic evolutionary rate comparisons indicate that similar selective pressures acted along the G. magnirostris and zebra finch lineages suggesting that historical effective population size values have been similar in both lineages. 21 otherwise highly conserved genes were identified that each show evidence for positive selection on amino acid changes in the Darwin's finch lineage. Two of these genes (Igf2r and Pou1f1) have been implicated in beak morphology changes in Darwin's finches. Five of 47 genes showing evidence of positive selection in early passerine evolution have cilia related functions, and may be examples of adaptively evolving reproductive proteins. Conclusions: These results provide insights into past evolutionary processes that have shaped G. magnirostris genes and its genome, and provide the necessary foundation upon which to build population genomics resources that will shed light on more contemporaneous adaptive and non-adaptive processes that have contributed to the evolution of the Darwin's finches.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Darling, Aaron (författare)
  • Fujita, Matthew (författare)
  • Kong, Lesheng (författare)
  • Webster, Matthew T. (författare)
  • Clabaut, Celine (författare)
  • Emes, Richard D. (författare)
  • Heger, Andreas (författare)
  • Meader, Stephen (författare)
  • Hawkins, Michael Brent (författare)
  • Eisen, Michael B. (författare)
  • Teiling, Clotilde (författare)
  • Affourtit, Jason (författare)
  • Boese, Benjamin (författare)
  • Grant, Peter R. (författare)
  • Grant, Barbara Rosemary (författare)
  • Eisen, Jonathan A. (författare)
  • Abzhanov, Arhat (författare)
  • Ponting, Chris P. (författare)
  • Uppsala universitetMedicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
  • Uppsala universitetScience for Life Laboratory, SciLifeLab (utgivare)

Sammanhörande titlar

  • Del av/supplement till:channel record
  • Ingår i:VärdpublikationBMC Genomics14, 951471-2164

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy