Generation of validated antibodies towards the human proteome

Tyck till om SwePub Sök här!

QC 20100705
Here we show the results from a large effort to generate antibodies towards the human proteome. A high-throughput strategy was developed based on cloning and expression of antigens as recombitant protein epitope signature tags (PrESTs) Affinity purified polyclonal antibodies were generated, followed by validation by protein microarrays, Western blotting and microarray-based immunohistochemistry. PrESTs were selected based on sequence uniqueness relative the proteome and a bioinformatics analysis showed that unique antigens can be found for at least 85% of the proteome using this general strategy. The success rate from antigen selection to validated antibodies was 31%, and from protein to antibody 55%. Interestingly, membrane-bound and soluble proteins performed equally and PrEST lengths between 75 and 125 amino acids were found to give the highest yield of validated antibodies. Multiple antigens were selected for many genes and the results suggest that specific antibodies can be systematically generated to most human proteibs.

Björling, ErikKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u15l719e (författare)
Gry, MarcusKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1dzuui2 (författare)
Asplund, AnnaUppsala Univ, Rudbeck laboratory (författare)
Al-Khalili Szigyarto, CristinaKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1c02mh9 (författare)
Persson, AnjaKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1ub8a38 (författare)
Ottoson, JennyKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1lthxtb (författare)
Wernérus, HenrikKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1v2ednd (författare)
Nilsson, PeterKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1ws88sk (författare)
Sivertsson, ÅsaKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u195d5b0 (författare)
Wester, KennethUppsala Univ, Rudbeck laboratory (författare)
Kampf, CarolineUppsala Univ, Rudbeck laboratory (författare)
Hober, SophiaKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u11qqzc1 (författare)
Pontén, FredrikUppsala Univ, Rudbeck laboratory (författare)
Uhlén, MathiasKTH,Skolan för bioteknologi (BIO)(Swepub:kth)u1dulvmw (författare)
KTHSkolan för bioteknologi (BIO) (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Berglund, Lisa; Björling, Erik; Gry, Marcus; Asplund, Anna; Al-Khalili Szigy ...; Persson, Anja; visa fler...; Ottoson, Jenny; Wernérus, Henrik; Nilsson, Peter; Sivertsson, Åsa; Wester, Kenneth; Kampf, Caroline; Hober, Sophia; Pontén, Fredrik; Uhlén, Mathias; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.