SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Krawczak Michael)
 

Sökning: WFRF:(Krawczak Michael) > Hofman Albert > Wichmann Heinz Erich > An evaluation of th...

  • Tehua Lu, TimothyUniversity of Kiel (författare)

An evaluation of the genetic-matched pair study design using genome-wide SNP data from the European population

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2009-01-21
  • Springer Science and Business Media LLC,2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-53858
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-53858URI
  • https://doi.org/10.1038/ejhg.2008.266DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Genetic matching potentially provides a means to alleviate the effects of incomplete Mendelian randomization in population-based gene-disease association studies. We therefore evaluated the genetic-matched pair study design on the basis of genome-wide SNP data (309 790 markers; Affymetrix GeneChip Human Mapping 500K Array) from 2457 individuals, sampled at 23 different recruitment sites across Europe. Using pair-wise identity-by-state (IBS) as a matching criterion, we tried to derive a subset of markers that would allow identification of the best overall matching (BOM) partner for a given individual, based on the IBS status for the subset alone. However, our results suggest that, by following this approach, the prediction accuracy is only notably improved by the first 20 markers selected, and increases proportionally to the marker number thereafter. Furthermore, in a considerable proportion of cases (76.0%), the BOM of a given individual, based on the complete marker set, came from a different recruitment site than the individual itself. A second marker set, specifically selected for ancestry sensitivity using singular value decomposition, performed even more poorly and was no more capable of predicting the BOM than randomly chosen subsets. This leads us to conclude that, at least in Europe, the utility of the genetic-matched pair study design depends critically on the availability of comprehensive genotype information for both cases and controls. European Journal of Human Genetics (2009) 17, 967-975; doi:10.1038/ejhg.2008.266; published online 21 January 2009

Ämnesord och genrebeteckningar

  • population structure; matching; association; ancestry; microarray
  • TECHNOLOGY
  • TEKNIKVETENSKAP

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Lao, OscarErasmus University (författare)
  • Nothnagel, MichaelUniversity of Kiel (författare)
  • Junge, OlafUniversity of Kiel (författare)
  • Freitag-Wolf, SandraUniversity of Kiel (författare)
  • Caliebe, AmkeUniversity of Kiel (författare)
  • Balascakova, MiroslavaCharles University of Prague (författare)
  • Bertranpetit, JaumeUniversity of Pompeu Fabra (författare)
  • Albert Bindoff, LaurenceHaukeland Hospital (författare)
  • Comas, DavidUniversity of Pompeu Fabra (författare)
  • Holmlund, GunillaLinköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet(Swepub:liu)gunho29 (författare)
  • Kouvatsi, AnastasiaAristotle University of Thessaloniki (författare)
  • Macek, MilanCharles University of Prague (författare)
  • Mollet, IsabelleEFS RA Site Lyon (författare)
  • Nielsen, FinnUniversity of Copenhagen (författare)
  • Parson, WaltherMedical University of Innsbruck (författare)
  • Palo, JukkaUniversity of Helsinki (författare)
  • Ploski, RafalWarsaw Medical University (författare)
  • Sajantila, AnttiUniversity of Helsinki (författare)
  • Tagliabracci, AdrianoUniversity of Ancona (författare)
  • Gether, UlrikUniversity of Copenhagen (författare)
  • Werge, ThomasCopenhagen University Hospital (författare)
  • Rivadeneira, FernandoErasmus University (författare)
  • Hofman, AlbertErasmus University (författare)
  • Gerardus Uitterlinden, AndreErasmus University (författare)
  • Gieger, ChristianGerman Research Centre for Environmental Health (författare)
  • Wichmann, Heinz-ErichGerman Research Centre for Environmental Health (författare)
  • Ruether, AndreasUniversity of Kiel (författare)
  • Schreiber, StefanUniversity of Kiel (författare)
  • Becker, ChristianUniversity of Cologne (författare)
  • Nuernberg, PeterUniversity of Cologne (författare)
  • Roberts Nelson, MatthewGlaxoSmithKline Inc (författare)
  • Kayser, ManfredErasmus University (författare)
  • Krawczak, MichaelUniversity of Kiel (författare)
  • University of KielErasmus University (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:European Journal of Human Genetics: Springer Science and Business Media LLC17:7, s. 967-9751018-48131476-5438

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy