SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ryde Ulf)
 

Sökning: WFRF:(Ryde Ulf) > Protein Flexibility...

Protein Flexibility and Conformational Entropy in Ligand Design Targeting the Carbohydrate Recognition Domain of Galectin-3.

Diehl, Carl (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biofysikalisk kemi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biophysical Chemistry,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Engström, Olof (författare)
Delaine, Tamara (författare)
Lund University,Lunds universitet,Centrum för analys och syntes,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Centre for Analysis and Synthesis,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
visa fler...
Håkansson, Maria (författare)
Lund University,Lunds universitet,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Genheden, Samuel (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningskemi,Enheten för fysikalisk och teoretisk kemi,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Computational Chemistry,Physical and theoretical chemistry,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Modig, Kristofer (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biofysikalisk kemi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biophysical Chemistry,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Leffler, Hakon (författare)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för mikrobiologi, immunologi och glykobiologi - MIG,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Microbiology, Immunology and Glycobiology - MIG,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
Ryde, Ulf (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningskemi,Enheten för fysikalisk och teoretisk kemi,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Computational Chemistry,Physical and theoretical chemistry,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Nilsson, Ulf (författare)
Lund University,Lunds universitet,Centrum för analys och syntes,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Centre for Analysis and Synthesis,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Akke, Mikael (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biofysikalisk kemi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biophysical Chemistry,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2010-09-28
2010
Engelska.
Ingår i: Journal of the American Chemical Society. - : American Chemical Society (ACS). - 1520-5126 .- 0002-7863. ; 132, s. 14577-14589
Relaterad länk:
http://www.ncbi.nlm....
visa fler...
http://dx.doi.org/10...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Rational drug design is predicated on knowledge of the three-dimensional structure of the protein-ligand complex and the thermodynamics of ligand binding. Despite the fundamental importance of both enthalpy and entropy in driving ligand binding, the role of conformational entropy is rarely addressed in drug design. In this work, we have probed the conformational entropy and its relative contribution to the free energy of ligand binding to the carbohydrate recognition domain of galectin-3. Using a combination of NMR spectroscopy, isothermal titration calorimetry, and X-ray crystallography, we characterized the binding of three ligands with dissociation constants ranging over 2 orders of magnitude. (15)N and (2)H spin relaxation measurements showed that the protein backbone and side chains respond to ligand binding by increased conformational fluctuations, on average, that differ among the three ligand-bound states. Variability in the response to ligand binding is prominent in the hydrophobic core, where a distal cluster of methyl groups becomes more rigid, whereas methyl groups closer to the binding site become more flexible. The results reveal an intricate interplay between structure and conformational fluctuations in the different complexes that fine-tunes the affinity. The estimated change in conformational entropy is comparable in magnitude to the binding enthalpy, demonstrating that it contributes favorably and significantly to ligand binding. We speculate that the relatively weak inherent protein-carbohydrate interactions and limited hydrophobic effect associated with oligosaccharide binding might have exerted evolutionary pressure on carbohydrate-binding proteins to increase the affinity by means of conformational entropy.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy