SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ewels Philip)
 

Sökning: WFRF:(Ewels Philip) > (2016) > MultiQC :

MultiQC : summarize analysis results for multiple tools and samples in a single report

Ewels, Philip (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
Magnusson, Måns (författare)
Karolinska Institutet
Lundin, Sverker (författare)
visa fler...
Käller, Max (författare)
KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2016-06-16
2016
Engelska.
Ingår i: Bioinformatics. - : Oxford University Press (OUP). - 1367-4803 .- 1367-4811. ; 32:19, s. 3047-3048
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Motivation: Fast and accurate quality control is essential for studies involving next-generation sequencing data. Whilst numerous tools exist to quantify QC metrics, there is no common approach to flexibly integrate these across tools and large sample sets. Assessing analysis results across an entire project can be time consuming and error prone; batch effects and outlier samples can easily be missed in the early stages of analysis.Results: We present MultiQC, a tool to create a single report visualising output from multiple tools across many samples, enabling global trends and biases to be quickly identified. MultiQC can plot data from many common bioinformatics tools and is built to allow easy extension and customization.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Miljöbioteknik (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Environmental Biotechnology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Matematik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Mathematics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy