SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Folsom Aaron R.)
 

Sökning: WFRF:(Folsom Aaron R.) > Genome- wide associ...

  • Sennblad, BengtStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Karolinska Institutet, Sweden (författare)

Genome- wide association study with additional genetic and post-transcriptional analyses reveals novel regulators of plasma factor XI levels

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-01-04
  • Oxford University Press (OUP),2017
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-142398
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-142398URI
  • https://doi.org/10.1093/hmg/ddw401DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:135411141URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Coagulation factor XI (FXI) has become increasingly interesting for its role in pathogenesis of thrombosis. While elevated plasma levels of FXI have been associated with venous thromboembolism and ischemic stroke, its deficiency is associated with mild bleeding. We aimed to determine novel genetic and post-transcriptional plasma FXI regulators. We performed a genome-wide association study (GWAS) for plasma FXI levels, using novel data imputed to the 1000 Genomes reference panel. Individual GWAS analyses, including a total of 16,169 European individuals from the ARIC, GHS, MARTHA and PROCARDIS studies, were meta-analysed and further replicated in 2,045 individuals from the F5L family, GAIT2 and MEGA studies. Additional association with activated partial thromboplastin time (aPTT) was tested for the top SNPs. In addition, a study on the effect of miRNA on FXI regulation was performed using in silico prediction tools and in vitro luciferase assays. Three loci showed robust, replicating association with circulating FXI levels: KNG1 (rs710446, P-value = 2.07 x 10(-302)), F11 (rs4253417, P-value = 2.86 x 10(-193)), and a novel association in GCKR (rs780094, P-value = 3.56 x 10(-09)), here for the first time implicated in FXI regulation. The two first SNPs (rs710446 and rs4253417) also associated with aPTT. Conditional and haplotype analyses demonstrated a complex association signal, with additional novel SNPs modulating plasma FXI levels in both the F11 and KNG1 loci. Finally, eight miRNAs were predicted to bind F11 mRNA. Over-expression of either miR-145 or miR-181 significantly reduced the luciferase activity in cells transfected with a plasmid containing FXI-3'UTR. These results should open the door to new therapeutic targets for thrombosis prevention.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Basu, Saonli (författare)
  • Mazur, Johanna (författare)
  • Suchon, Pierre (författare)
  • Martinez-Perez, Angel (författare)
  • Vlieg, Astrid van Hylckama (författare)
  • Vinh, Truong (författare)
  • Li, Yuhuang (författare)
  • Gadin, Jesper R.Karolinska Institutet (författare)
  • Tang, Weihong (författare)
  • Grossman, Vera (författare)
  • de Haan, Hugoline G. (författare)
  • Handin, Niklas (författare)
  • Silveira, AngelaKarolinska Institutet (författare)
  • Carlos Souto, Juan (författare)
  • Franco-Cereceda, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Morange, Pierre-Emmanuel (författare)
  • Gagnon, France (författare)
  • Manuel Soria, Jose (författare)
  • Eriksson, PerKarolinska Institutet (författare)
  • Hamsten, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Maegdefessel, LarsKarolinska Institutet (författare)
  • Rosendaal, Frits R. (författare)
  • Wild, Philipp (författare)
  • Folsom, Aaron R. (författare)
  • Tregouet, David-Alexandre (författare)
  • Sabater-Lleal, MariaKarolinska Institutet (författare)
  • Stockholms universitetInstitutionen för biokemi och biofysik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Human Molecular Genetics: Oxford University Press (OUP)26:3, s. 637-6490964-69061460-2083

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy