Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Kauppinen Timo) > Shapiguzov Alexey > Genome sequencing a...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Salojarvi, JarkkoUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)

Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch

Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2017-05-08
NATURE PUBLISHING GROUP,2017
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-137059
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-137059URI
https://doi.org/10.1038/ng.3862DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-327136URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Errata: Salojärvi, J., Smolander, OP., Nieminen, K. et al. Author Correction: Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch. Nat Genet 51, 1187–1189 (2019). https://doi.org/10.1038/s41588-019-0442-7
Silver birch (Betula pendula) is a pioneer boreal tree that can be induced to flower within 1 year. Its rapid life cycle, small (440-Mb) genome, and advanced germplasm resources make birch an attractive model for forest biotechnology. We assembled and chromosomally anchored the nuclear genome of an inbred B. pendula individual. Gene duplicates from the paleohexaploid event were enriched for transcriptional regulation, whereas tandem duplicates were overrepresented by environmental responses. Population resequencing of 80 individuals showed effective population size crashes at major points of climatic upheaval. Selective sweeps were enriched among polyploid duplicates encoding key developmental and physiological triggering functions, suggesting that local adaptation has tuned the timing of and cross-talk between fundamental plant processes. Variation around the tightly-linked light response genes PHYC and FRS10 correlated with latitude and longitude and temperature, and with precipitation for PHYC. Similar associations characterized the growth-promoting cytokinin response regulator ARR1, and the wood development genes KAK and MED5A.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Smolander, Olli-PekkaUniv Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Nieminen, KaisaNat Resources Inst Finland Luke, Green Technol, Helsinki, Finland. (författare)
Rajaraman, SitaramUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Safronov, OmidUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Safdari, PezhmanUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Lamminmaki, AiriUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Immanen, JuhaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Lan, TianyingUniv Buffalo, Dept Biol Sci, Buffalo, NY USA. (författare)
Tanskanen, JaakkoUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Nat Resources Inst Finland Luke, Green Technol, Helsinki, Finland. (författare)
Rastas, PasiUniv Cambridge, Dept Zool, Cambridge, England.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland. (författare)
Amiryousefi, AliUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.,Univ Buffalo, Dept Biol Sci, Buffalo, NY USA. (författare)
Jayaprakash, BalamuralikrishnaUniv Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Natl Inst Hlth & Welf THL, Kuopio, Finland. (författare)
Kammonen, Juhana I.Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Hagqvist, RistoNat Resources Inst Finland Luke, Green Technol, Haapastensyrja, Layliainen, Finland. (författare)
Eswaran, GuganUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Ahonen, Viivi HelenaUniv Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Kuopio, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Work Environm Labs, Finnish Inst Occupat Hlth, Kuopio, Finland. (författare)
Serra, Juan AlonsoUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Asiegbu, Fred O.Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Forest Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Barajas-Lopez, Juan de Dios (författare)
Blande, DanielUniv Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Kuopio, Finland. (författare)
Blokhina, OlgaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland. (författare)
Blomster, TiinaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Broholm, SuviUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland. (författare)
Brosche, MikaelUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Tartu, Inst Technol, Tartu, Estonia. (författare)
Cui, FuqiangUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Zhejiang Agr & Forestry Univ, Sch Forest Biotechnol, Hangzhou, Zhejiang, Peoples R China. (författare)
Dardick, ChrisUSDA, Appalachian Fruit Res Stn, Agr Res Serv, Kearnysville, WV USA. (författare)
Escamez, SachaUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik(Swepub:umu)saes0009 (författare)
Elomaa, PaulaUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Genet, Helsinki, Finland. (författare)
Escamez, SachaUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik(Swepub:umu)saes0009 (författare)
Fagerstedt, Kurt V.Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Fujii, HiroakiUniv Turku, Dept Biochem, Mol Plant Biol, Turku, Finland. (författare)
Gauthier, AdrienUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;UniLaSalle, Unite AGRI TERR, Campus Rouen, Mont St Aignan, France. (författare)
Gollan, Peter J.Univ Turku, Dept Biochem, Mol Plant Biol, Turku, Finland. (författare)
Halimaa, Pauliina (författare)
Heino, Pekka I.Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Genet, Helsinki, Finland. (författare)
Himanen, KristiinaUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Hollender, CourtneyUSDA, Appalachian Fruit Res Stn, Agr Res Serv, Kearnysville, WV USA. (författare)
Kangasjarvi, SaijaliisaUniv Turku, Dept Biochem, Mol Plant Biol, Turku, Finland. (författare)
Kauppinen, LeilaUniv Helsinki, Dept Biosci, Helsinki, Finland. (författare)
Kelleher, Colin T.Natl Bot Gardens Ireland, DBN Plant Mol Lab, Dublin, Ireland. (författare)
Kontunen-Soppela, SariUniv Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Joensuu, Finland. (författare)
Koskinen, J. PatrikUniv Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Blueprint Genet, Helsinki, Finland. (författare)
Kovalchuk, AndriyUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Forest Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Karenlampi, Sirpa O.Univ Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Kuopio, Finland. (författare)
Karkonen, Anna K.Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Nat Resources Inst Finland Luke, Green Technol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland. (författare)
Lim, Kean-JinUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Leppala, JohannaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Macpherson, LeeKings Coll London, Dept Haemato Oncol, London, England. (författare)
Mikola, JuhaUniv Helsinki, Dept Environm Sci, Helsinki, Finland.,Nat Resources Inst Finland Luke, Management & Prod Renewable Resources, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Royal Haskoning DHV, Maastricht Airport, Beek, Netherlands. (författare)
Mouhu, KatriinaUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Mahonen, Ari PekkaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Niinemets, UloEstonian Univ Life Sci, Inst Agr & Environm Sci, Tartu, Estonia. (författare)
Oksanen, ElinaUniv Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Joensuu, Finland. (författare)
Overmyer, KirkUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Palva, E. Tapio (författare)
Pazouki, LeilaEstonian Univ Life Sci, Inst Agr & Environm Sci, Tartu, Estonia. (författare)
Pennanen, VilleUniv Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Genet, Helsinki, Finland. (författare)
Puhakainen, TuulaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Genet, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Sci Agr Soc Finland, Agr & Food Sci, Lemu, Finland. (författare)
Poczai, PeterUniv Helsinki, Finnish Museum Nat Hist Botany, Helsinki, Finland.,Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Possen, Boy J. H. M. (författare)
Punkkinen, MatleenaUniv Turku, Dept Biochem, Mol Plant Biol, Turku, Finland. (författare)
Rahikainen, Moona M.Univ Turku, Dept Biochem, Mol Plant Biol, Turku, Finland. (författare)
Rousi, MattiNat Resources Inst Finland Luke, Management & Prod Renewable Resources, Helsinki, Finland. (författare)
Ruonala, RailiUniv Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Univ Cambridge, Sainsbury Lab, Cambridge, England.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland. (författare)
van der Schoot, ChristiaanNorwegian Univ Life Sci, Dept Plant Sci, As, Norway. (författare)
Shapiguzov, AlexeyUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Russian Acad Sci, Inst Plant Physiol, Moscow, Russia. (författare)
Sierla, MaijaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Sipila, Timo P. (författare)
Sutela, SuviUniv Oulu, Genet & Physiol Unit, Oulu, Finland. (författare)
Teeri, Teemu H.Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Agr Sci, Helsinki, Finland. (författare)
Tervahauta, Arja I.Univ Eastern Finland, Dept Environm & Biol Sci, Kuopio, Finland. (författare)
Vaattovaara, AleksiaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Vahala, JormaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Vetchinnikova, LidiaRussian Acad Sci, Karelian Res Ctr, Forest Res Inst, Petrozavodsk, Russia. (författare)
Welling, AnnikkiUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Finnish Food Safety Author Evira, Chem & Toxicol Res Unit, Helsinki, Finland. (författare)
Wrzaczek, MichaelUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland. (författare)
Xu, EnjunUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, Helsinki, Finland.;Chinese Acad Sci, Inst Bot, Beijing, Peoples R China. (författare)
Paulin, Lars G.Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Schulman, Alan H.Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Nat Resources Inst Finland Luke, Green Technol, Helsinki, Finland. (författare)
Lascoux, MartinUppsala universitet,Växtekologi och evolution,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)martlasc (författare)
Albert, Victor A. (författare)
Auvinen, PetriUniv Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (författare)
Helariutta, YkaUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland.;Univ Cambridge, Sainsbury Lab, Cambridge, England. (författare)
Kangasjarvi, JaakkoUniv Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland. (författare)
Univ Helsinki, Dept Biosci, Div Plant Biol, Helsinki, Finland.;Univ Helsinki, Viikki Plant Sci Ctr, Helsinki, Finland.Univ Helsinki, Inst Biotechnol, Helsinki, Finland. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Genetics: NATURE PUBLISHING GROUP49:6, s. 904-9121061-40361546-1718

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Salojarvi, Jarkk ...; Smolander, Olli- ...; Nieminen, Kaisa; Rajaraman, Sitar ...; Safronov, Omid; Safdari, Pezhman; visa fler...; Lamminmaki, Airi; Immanen, Juha; Lan, Tianying; Tanskanen, Jaakk ...; Rastas, Pasi; Amiryousefi, Ali; Jayaprakash, Bal ...; Kammonen, Juhana ...; Hagqvist, Risto; Eswaran, Gugan; Ahonen, Viivi He ...; Serra, Juan Alon ...; Asiegbu, Fred O.; Barajas-Lopez, J ...; Blande, Daniel; Blokhina, Olga; Blomster, Tiina; Broholm, Suvi; Brosche, Mikael; Cui, Fuqiang; Dardick, Chris; Escamez, Sacha; Elomaa, Paula; Fagerstedt, Kurt ...; Fujii, Hiroaki; Gauthier, Adrien; Gollan, Peter J.; Halimaa, Pauliin ...; Heino, Pekka I.; Himanen, Kristii ...; Hollender, Court ...; Kangasjarvi, Sai ...; Kauppinen, Leila; Kelleher, Colin ...; Kontunen-Soppela ...; Koskinen, J. Pat ...; Kovalchuk, Andri ...; Karenlampi, Sirp ...; Karkonen, Anna K ...; Lim, Kean-Jin; Leppala, Johanna; Macpherson, Lee; Mikola, Juha; Mouhu, Katriina; Mahonen, Ari Pek ...; Niinemets, Ulo; Oksanen, Elina; Overmyer, Kirk; Palva, E. Tapio; Pazouki, Leila; Pennanen, Ville; Puhakainen, Tuul ...; Poczai, Peter; Possen, Boy J. H ...; Punkkinen, Matle ...; Rahikainen, Moon ...; Rousi, Matti; Ruonala, Raili; van der Schoot, ...; Shapiguzov, Alex ...; Sierla, Maija; Sipila, Timo P.; Sutela, Suvi; Teeri, Teemu H.; Tervahauta, Arja ...; Vaattovaara, Ale ...; Vahala, Jorma; Vetchinnikova, L ...; Welling, Annikki; Wrzaczek, Michae ...; Xu, Enjun; Paulin, Lars G.; Schulman, Alan H ...; Lascoux, Martin; Albert, Victor A ...; Auvinen, Petri; Helariutta, Yka; Kangasjarvi, Jaa ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

Artiklar i publikationen: Nature Genetics

Av lärosätet: Umeå universitet; Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se