SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Strawbridge Rona J.)
 

Sökning: WFRF:(Strawbridge Rona J.) > (2011) > Svenungsson Elisabet > A candidate gene st...

  • Sandling, Johanna K.Uppsala universitet,Molekylär medicin (författare)

A candidate gene study of the type I interferon pathway implicates IKBKE and IL8 as risk loci for SLE

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2010-12-22
  • Springer Science and Business Media LLC,2011
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-139459
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-139459URI
  • https://doi.org/10.1038/ejhg.2010.197DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/1936264URI
  • https://res.slu.se/id/publ/47068URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-41446URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:122185039URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska &language:-1_t

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Systemic Lupus Erythematosus (SLE) is a systemic autoimmune disease in which the type I interferon pathway has a crucial role. We have previously shown that three genes in this pathway, IRF5, TYK2 and STAT4, are strongly associated with risk for SLE. Here, we investigated 78 genes involved in the type I interferon pathway to identify additional SLE susceptibility loci. First, we genotyped 896 single-nucleotide polymorphisms in these 78 genes and 14 other candidate genes in 482 Swedish SLE patients and 536 controls. Genes with P<0.01 in the initial screen were then followed up in 344 additional Swedish patients and 1299 controls. SNPs in the IKBKE, TANK, STAT1, IL8 and TRAF6 genes gave nominal signals of association with SLE in this extended Swedish cohort. To replicate these findings we extracted data from a genomewide association study on SLE performed in a US cohort. Combined analysis of the Swedish and US data, comprising a total of 2136 cases and 9694 controls, implicates IKBKE and IL8 as SLE susceptibility loci (P(meta)=0.00010 and P(meta)=0.00040, respectively). STAT1 was also associated with SLE in this cohort (P(meta)=3.3 × 10(-5)), but this association signal appears to be dependent of that previously reported for the neighbouring STAT4 gene. Our study suggests additional genes from the type I interferon system in SLE, and highlights genes in this pathway for further functional analysis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Garnier, SophieUppsala universitet,Molekylär medicin (författare)
  • Sigurdsson, SnaevarUppsala universitet,Molekylär medicin (författare)
  • Wang, ChuanUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)chuwa904 (författare)
  • Nordmark, GunnelUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Systemic Autoimmunity(Swepub:uu)gunnnord (författare)
  • Gunnarsson, IvaKarolinska Institutet (författare)
  • Svenungsson, ElisabetKarolinska Institutet (författare)
  • Padyukov, LeonidKarolinska Institutet (författare)
  • Sturfelt, GunnarLund University,Lunds universitet,Reumatologi och molekylär skelettbiologi,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Rheumatology,Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)reum-gst (författare)
  • Jönsen, AndreasLund University,Lunds universitet,Reumatologi och molekylär skelettbiologi,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Rheumatology,Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)reum-ajo (författare)
  • Bengtsson, AndersLund University,Lunds universitet,Reumatologi och molekylär skelettbiologi,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Rheumatology,Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)reum-abe (författare)
  • Truedsson, LennartLund University,Lunds universitet,Avdelningen för mikrobiologi, immunologi och glykobiologi - MIG,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Microbiology, Immunology and Glycobiology - MIG,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)mmb-ltr (författare)
  • Eriksson, Catharina,1955-Umeå universitet,Klinisk immunologi(Swepub:umu)caaern74 (författare)
  • Rantapää-Dahlqvist, SolbrittUmeå universitet,Reumatologi(Swepub:umu)sora0001 (författare)
  • Mälarstig, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Strawbridge, Rona J.Karolinska Institutet (författare)
  • Hamsten, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Criswell, Lindsey A. (författare)
  • Graham, Robert R. (författare)
  • Behrens, Timothy W. (författare)
  • Eloranta, Maija-LeenaUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Systemic Autoimmunity(Swepub:uu)maelo020 (författare)
  • Alm, GunnarSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Inst för biomedicin och veterinär folkhälsovetenskap,Department of Biomedical Science and Veterinary Public Health(Swepub:slu)48141 (författare)
  • Rönnblom, LarsUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Systemic Autoimmunity(Swepub:uu)larsronn (författare)
  • Syvänen, Ann-ChristineUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)anncsyva (författare)
  • Uppsala universitetMolekylär medicin (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:European Journal of Human Genetics: Springer Science and Business Media LLC19:4, s. 479-4841018-48131476-5438

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy