Tyck till om SwePub Sök här!
WFRF:(Krogh Jesper)
Sökning: WFRF:(Krogh Jesper) > Recalibrating Equus...
- 1 av 27
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse
- Orlando, Ludovic (författare)
- Ginolhac, Aurelien (författare)
- Zhang, Guojie (författare)
- visa fler...
- Froese, Duane (författare)
- Albrechtsen, Anders (författare)
- Stiller, Mathias (författare)
- Schubert, Mikkel (författare)
- Cappellini, Enrico (författare)
- Petersen, Bent (författare)
- Moltke, Ida (författare)
- Johnson, Philip L. F. (författare)
- Fumagalli, Matteo (författare)
- Vilstrup, Julia T. (författare)
- Raghavan, Maanasa (författare)
- Korneliussen, Thorfinn (författare)
- Malaspinas, Anna-Sapfo (författare)
- Vogt, Josef (författare)
- Szklarczyk, Damian (författare)
- Kelstrup, Christian D. (författare)
- Vinther, Jakob (författare)
- Dolocan, Andrei (författare)
- Stenderup, Jesper (författare)
- Velazquez, Amhed M. V. (författare)
- Cahill, James (författare)
- Rasmussen, Morten (författare)
- Wang, Xiaoli (författare)
- Min, Jiumeng (författare)
- Zazula, Grant D. (författare)
- Seguin-Orlando, Andaine (författare)
- Mortensen, Cecilie (författare)
- Magnussen, Kim (författare)
- Thompson, John F. (författare)
- Weinstock, Jacobo (författare)
- Gregersen, Kristian (författare)
- Roed, Knut H. (författare)
- Eisenmann, Vera (författare)
- Miller, Donald C. (författare)
- Antczak, Douglas F. (författare)
- Bertelsen, Mads F. (författare)
- Brunak, Soren (författare)
- Al-Rasheid, Khaled A. S. (författare)
- Ryder, Oliver (författare)
- Mundy, John (författare)
- Krogh, Anders (författare)
- Gilbert, M. Thomas P. (författare)
- Kjaer, Kurt (författare)
- Sicheritz-Ponten, Thomas (författare)
- Jensen, Lars Juhl (författare)
- Olsen, Jesper V. (författare)
- Hofreiter, Michael (författare)
- Nielsen, Rasmus (författare)
- Shapiro, Beth (författare)
- Wang, Jun (författare)
- Willerslev, Eske (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2013-06-26
- 2013
- Engelska.
- Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 499:7456, s. 74-
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The rich fossil record of equids has made them a model for evolutionary processes(1). Here we present a 1.12-times coverage draft genome from a horse bone recovered from permafrost dated to approximately 560-780 thousand years before present (kyr BP)(2,3). Our data represent the oldest full genome sequence determined so far by almost an order of magnitude. For comparison, we sequenced the genome of a Late Pleistocene horse (43 kyr BP), and modern genomes of five domestic horse breeds (Equus ferus caballus), a Przewalski's horse (E. f. prze-walskii) and a donkey (E. asinus). Our analyses suggest that the Equus lineage giving rise to all contemporary horses, zebras and donkeys originated 4.0-4.5 million years before present (Myr BP), twice the conventionally accepted time to the most recent common ancestor of the genus Equus(4,5). We also find that horse population size fluctuated multiple times over the past 2 Myr, particularly during periods of severe climatic changes. We estimate that the Przewalski's and domestic horse populations diverged 38-72 kyr BP, and find no evidence of recent admixture between the domestic horse breeds and the Przewalski's horse investigated. This supports the contention that Przewalski's horses represent the last surviving wild horse population(6). We find similar levels of genetic variation among Przewalski's and domestic populations, indicating that the former are genetically viable and worthy of conservation efforts. We also find evidence for continuous selection on the immune system and olfaction throughout horse evolution. Finally, we identify 29 genomic regions among horse breeds that deviate from neutrality and show low levels of genetic variation compared to the Przewalski's horse. Such regions could correspond to loci selected early during domestication.
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 27
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Orlando, Ludovic
- Ginolhac, Aureli ...
- Zhang, Guojie
- Froese, Duane
- Albrechtsen, And ...
- Stiller, Mathias
- visa fler...
- Schubert, Mikkel
- Cappellini, Enri ...
- Petersen, Bent
- Moltke, Ida
- Johnson, Philip ...
- Fumagalli, Matte ...
- Vilstrup, Julia ...
- Raghavan, Maanas ...
- Korneliussen, Th ...
- Malaspinas, Anna ...
- Vogt, Josef
- Szklarczyk, Dami ...
- Kelstrup, Christ ...
- Vinther, Jakob
- Dolocan, Andrei
- Stenderup, Jespe ...
- Velazquez, Amhed ...
- Cahill, James
- Rasmussen, Morte ...
- Wang, Xiaoli
- Min, Jiumeng
- Zazula, Grant D.
- Seguin-Orlando, ...
- Mortensen, Cecil ...
- Magnussen, Kim
- Thompson, John F ...
- Weinstock, Jacob ...
- Gregersen, Krist ...
- Roed, Knut H.
- Eisenmann, Vera
- Rubin, Carl-Joha ...
- Miller, Donald C ...
- Antczak, Douglas ...
- Bertelsen, Mads ...
- Brunak, Soren
- Al-Rasheid, Khal ...
- Ryder, Oliver
- Andersson, Leif
- Mundy, John
- Krogh, Anders
- Gilbert, M. Thom ...
- Kjaer, Kurt
- Sicheritz-Ponten ...
- Jensen, Lars Juh ...
- Olsen, Jesper V.
- Hofreiter, Micha ...
- Nielsen, Rasmus
- Shapiro, Beth
- Wang, Jun
- Willerslev, Eske
- visa färre...
- Artiklar i publikationen
- Nature
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
