SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Haakensen Vilde)
 

Sökning: WFRF:(Haakensen Vilde) > Borresen Dale Anne Lise > Genome-wide DNA met...

  • Fleischer, Thomas (författare)

Genome-wide DNA methylation profiles in progression to in situ and invasive carcinoma of the breast with impact on gene transcription and prognosis

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2014-08-22
  • Springer Science and Business Media LLC,2014
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-242038
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-242038URI
  • https://doi.org/10.1186/s13059-014-0435-xDOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background: Ductal carcinoma in situ (DCIS) of the breast is a precursor of invasive breast carcinoma. DNA methylation alterations are thought to be an early event in progression of cancer, and may prove valuable as a tool in clinical decision making and for understanding neoplastic development. Results: We generate genome-wide DNA methylation profiles of 285 breast tissue samples representing progression of cancer, and validate methylation changes between normal and DCIS in an independent dataset of 15 normal and 40 DCIS samples. We also validate a prognostic signature on 583 breast cancer samples from The Cancer Genome Atlas. Our analysis reveals that DNA methylation profiles of DCIS are radically altered compared to normal breast tissue, involving more than 5,000 genes. Changes between DCIS and invasive breast carcinoma involve around 1,000 genes. In tumors, DNA methylation is associated with gene expression of almost 3,000 genes, including both negative and positive correlations. A prognostic signature based on methylation level of 18 CpGs is associated with survival of breast cancer patients with invasive tumors, as well as with survival of patients with DCIS and mixed lesions of DCIS and invasive breast carcinoma. Conclusions: This work demonstrates that changes in the epigenome occur early in the neoplastic progression, provides evidence for the possible utilization of DNA methylation-based markers of progression in the clinic, and highlights the importance of epigenetic changes in carcinogenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Frigessi, Arnoldo (författare)
  • Johnson, Kevin C. (författare)
  • Edvardsen, Hege (författare)
  • Touleimat, Nizar (författare)
  • Klajic, Jovana (författare)
  • Riis, Margit L. H. (författare)
  • Haakensen, Vilde D. (författare)
  • Wärnberg, FredrikUppsala universitet,Endokrinkirurgi(Swepub:uu)fredwarn (författare)
  • Naume, Bjorn (författare)
  • Helland, Aslaug (författare)
  • Borresen-Dale, Anne-Lise (författare)
  • Tost, Jorg (författare)
  • Christensen, Brock C. (författare)
  • Kristensen, Vessela N. (författare)
  • Uppsala universitetEndokrinkirurgi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Biology: Springer Science and Business Media LLC15:8, s. 435-1465-69061474-760X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy