Large-Scale Gene-Centric Meta-analysis across 32 Studies Identifies Multiple Lipid Loci

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Munroe Patricia) > (2010-2014) > (2012) > Hingorani Aroon D > Large-Scale Gene-Ce...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Asselbergs, Folkert W. (författare)

Large-Scale Gene-Centric Meta-analysis across 32 Studies Identifies Multiple Lipid Loci

Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2012

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:19739b80-cdd4-4db7-b175-028cfda89d8f
https://lup.lub.lu.se/record/3244000URI
https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2012.08.032DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

Genome-wide association studies (GWASs) have identified many SNPs underlying variations in plasma-lipid levels. We explore whether additional loci associated with plasma-lipid phenotypes, such as high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C), total cholesterol (TC), and triglycerides (TGs), can be identified by a dense gene-centric approach. Our meta-analysis of 32 studies in 66,240 individuals of European ancestry was based on the custom similar to 50,000 SNP genotyping array (the ITMAT-Broad-CARe array) covering similar to 2,000 candidate genes. SNP-lipid associations were replicated either in a cohort comprising an additional 24,736 samples or within the Global Lipid Genetic Consortium. We identified four, six, ten, and four unreported SNPs in established lipid genes for HDL-C, LDL-C, TC, and TGs, respectively. We also identified several lipid-related SNPs in previously unreported genes: DGAT2, HCAR2, GPIHBP1, PPARG, and FTO for HDL-C; SOCS3, APOH, SPTY2D1, BRCA2, and VLDLR for LDL-C; SOCS3, UGT1A1, BRCA2, UBE3B, FCGR2A, CHUK, and INSIG2 for TC; and SERPINF2, C4B, GCK, GATA4, INSR, and LPAL2 for TGs. The proportion of explained phenotypic variance in the subset of studies providing individual-level data was 9.9% for HDL-C, 9.5% for LDL-C, 10.3% for TC, and 8.0% for TGs. This large meta-analysis of lipid phenotypes with the use of a dense gene-centric approach identified multiple SNPs not previously described in established lipid genes and several previously unknown loci. The explained phenotypic variance from this approach was comparable to that from a meta-analysis of GWAS data, suggesting that a focused genotyping approach can further increase the understanding of heritability of plasma lipids.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Guo, Yiran (författare)
van Iperen, Erik P. A. (författare)
Sivapalaratnam, Suthesh (författare)
Tragante, Vinicius (författare)
Lanktree, Matthew B. (författare)
Lange, Leslie A. (författare)
Almoguera, Berta (författare)
Appelman, Yolande E. (författare)
Barnard, John (författare)
Baumert, Jens (författare)
Beitelshees, Amber L. (författare)
Bhangale, Tushar R. (författare)
Chen, Yii-Der Ida (författare)
Gaunt, Tom R. (författare)
Gong, Yan (författare)
Hopewell, Jemma C. (författare)
Johnson, Toby (författare)
Kleber, Marcus E. (författare)
Langaee, Taimour Y. (författare)
Li, Mingyao (författare)
Li, Yun R. (författare)
Liu, Kiang (författare)
McDonough, Caitrin W. (författare)
Meijs, Matthijs El. (författare)
Middelberg, Rita P. S. (författare)
Musunuru, Kiran (författare)
Nelson, Christopher P. (författare)
O'Connell, Jeffery R. (författare)
Padmanabhan, Sandosh (författare)
Pankow, James S. (författare)
Pankratz, Nathan (författare)
Rafelt, Suzanne (författare)
Rajagopalan, Ramakrishnan (författare)
Romaine, Simon P. R. (författare)
Schork, Nicholas J. (författare)
Shaffer, Jonathan (författare)
Shen, Haiqing (författare)
Smith, Erin N. (författare)
Tischfield, Sam E. (författare)
van der Most, Peter J. (författare)
van Vliet-Ostaptchouk, Jana V. (författare)
Verweij, Niek (författare)
Volcik, Kelly A. (författare)
Zhang, Li (författare)
Bailey, Kent R. (författare)
Bailey, Kristian M. (författare)
Bauer, Florianne (författare)
Boer, Jolanda M. A. (författare)
Braund, Peter S. (författare)
Burt, Amber (författare)
Burton, Paul R. (författare)
Buxbaum, Sarah G. (författare)
Chen, Wei (författare)
Cooper-DeHoff, Rhonda M. (författare)
Cupples, L. Adrienne (författare)
deJong, Jonas S. (författare)
Delles, Christian (författare)
Duggan, David (författare)
Fornage, Myriam (författare)
Furlong, Clement E. (författare)
Glazer, Nicole (författare)
Gums, John G. (författare)
Hastie, Claire (författare)
Holmes, Michael V. (författare)
Illig, Thomas (författare)
Kirkland, Susan A. (författare)
Kivimaki, Mika (författare)
Klein, Ronald (författare)
Klein, Barbara E. (författare)
Kooperberg, Charles (författare)
Kottke-Marchant, Kandice (författare)
Kumari, Meena (författare)
LaCroix, Andrea Z. (författare)
Mallela, Laya (författare)
Murugesan, Gurunathan (författare)
Ordovas, Jose (författare)
Ouwehand, Willem H. (författare)
Post, Wendy S. (författare)
Saxena, Richa (författare)
Scharnagl, Hubert (författare)
Schreiner, Pamela J. (författare)
Shah, Tina (författare)
Shields, Denis C. (författare)
Shimbo, Daichi (författare)
Srinivasan, Sathanur R. (författare)
Stolk, Ronald P. (författare)
Swerdlow, Daniel I. (författare)
Taylor Jr, Herman A. (författare)
Topo, Eric J. (författare)
Toskala, Elina (författare)
van Pelt, Joost L. (författare)
van Setten, Jessica (författare)
Yusuf, Salim (författare)
Whittaker, John C. (författare)
Zwinderman, A. H. (författare)
Anand, Sonia S. (författare)
Balmforth, Anthony J. (författare)
Berenson, Gerald S. (författare)
Bezzina, Connie R. (författare)
Boehm, Bernhard O. (författare)
Boerwinkle, Eric (författare)
Casas, Juan P. (författare)
Caulfield, Mark J. (författare)
Clarke, Robert (författare)
Connell, John M. (författare)
Cruickshanks, Karen J. (författare)
Davidson, Karina W. (författare)
Day, Ian N. M. (författare)
de Bakker, Paul I. W. (författare)
Doevendans, Pieter A. (författare)
Dominiczak, Anna E. (författare)
Hall, Alistair S. (författare)
Hartman, Catharina A. (författare)
Hengstenberg, Christian (författare)
Hillege, Hans L. (författare)
Hofker, Marten H. (författare)
Humphries, Steve E. (författare)
Jarvik, Gail P. (författare)
Johnson, Julie A. (författare)
Kaess, Bernhard M. (författare)
Kathiresan, Sekar (författare)
Koenig, Wolfgang (författare)
Lawlor, Debbie A. (författare)
Maerz, Winfried (författare)
Melander, OlleLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-ome (författare)
Mitchell, Braxton D. (författare)
Montgomery, Grant W. (författare)
Munroe, Patricia B. (författare)
Murray, Sarah S. (författare)
Newhouse, Stephen J. (författare)
Onland-Moret, N. Charlotte (författare)
Poulter, Neil (författare)
Psaty, Bruce (författare)
Redline, Susan (författare)
Rich, Stephen S. (författare)
Rotter, Jerome I. (författare)
Schunkert, Heribert (författare)
Sever, Peter (författare)
Shuldiner, Alan R. (författare)
Silverstein, Roy L. (författare)
Stanton, Alice (författare)
Thorand, Barbara (författare)
Trip, Mieke D. (författare)
Tsai, Michael Y. (författare)
van der Harst, Pim (författare)
van der Schoot, Ellen (författare)
van der Schouw, Yvonne T. (författare)
Verschuren, W. M. Monique (författare)
Watkins, Hugh (författare)
Wilde, Arthur A. M. (författare)
Wolffenbuttel, Bruce H. R. (författare)
Whitfield, John B. (författare)
Hovingh, G. Kees (författare)
Ballantyne, Christie M. (författare)
Wijmenga, Cisca (författare)
Reilly, Muredach P. (författare)
Martin, Nicholas G. (författare)
Wilson, James G. (författare)
Rader, Daniel J. (författare)
Samani, Nilesh J. (författare)
Reiner, Alex P. (författare)
Hegele, Robert A. (författare)
Kastelein, John J. P. (författare)
Hingorani, Aroon D. (författare)
Talmud, Philippa J. (författare)
Hakonarson, Hakon (författare)
Elbers, Clara C. (författare)
Keating, Brendan J. (författare)
Drenos, Fotios (författare)
Kardiovaskulär forskning - hypertoniForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:American Journal of Human Genetics: Elsevier BV91:5, s. 823-8380002-9297

Internetlänk

Hitta via bibliotek

American Journal of Human Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Asselbergs, Folk ...; Guo, Yiran; van Iperen, Erik ...; Sivapalaratnam, ...; Tragante, Vinici ...; Lanktree, Matthe ...; visa fler...; Lange, Leslie A.; Almoguera, Berta; Appelman, Yoland ...; Barnard, John; Baumert, Jens; Beitelshees, Amb ...; Bhangale, Tushar ...; Chen, Yii-Der Id ...; Gaunt, Tom R.; Gong, Yan; Hopewell, Jemma ...; Johnson, Toby; Kleber, Marcus E ...; Langaee, Taimour ...; Li, Mingyao; Li, Yun R.; Liu, Kiang; McDonough, Caitr ...; Meijs, Matthijs ...; Middelberg, Rita ...; Musunuru, Kiran; Nelson, Christop ...; O'Connell, Jeffe ...; Padmanabhan, San ...; Pankow, James S.; Pankratz, Nathan; Rafelt, Suzanne; Rajagopalan, Ram ...; Romaine, Simon P ...; Schork, Nicholas ...; Shaffer, Jonatha ...; Shen, Haiqing; Smith, Erin N.; Tischfield, Sam ...; van der Most, Pe ...; van Vliet-Ostapt ...; Verweij, Niek; Volcik, Kelly A.; Zhang, Li; Bailey, Kent R.; Bailey, Kristian ...; Bauer, Florianne; Boer, Jolanda M. ...; Braund, Peter S.; Burt, Amber; Burton, Paul R.; Buxbaum, Sarah G ...; Chen, Wei; Cooper-DeHoff, R ...; Cupples, L. Adri ...; deJong, Jonas S.; Delles, Christia ...; Duggan, David; Fornage, Myriam; Furlong, Clement ...; Glazer, Nicole; Gums, John G.; Hastie, Claire; Holmes, Michael ...; Illig, Thomas; Kirkland, Susan ...; Kivimaki, Mika; Klein, Ronald; Klein, Barbara E ...; Kooperberg, Char ...; Kottke-Marchant, ...; Kumari, Meena; LaCroix, Andrea ...; Mallela, Laya; Murugesan, Gurun ...; Ordovas, Jose; Ouwehand, Willem ...; Post, Wendy S.; Saxena, Richa; Scharnagl, Huber ...; Schreiner, Pamel ...; Shah, Tina; Shields, Denis C ...; Shimbo, Daichi; Srinivasan, Sath ...; Stolk, Ronald P.; Swerdlow, Daniel ...; Taylor Jr, Herma ...; Topo, Eric J.; Toskala, Elina; van Pelt, Joost ...; van Setten, Jess ...; Yusuf, Salim; Whittaker, John ...; Zwinderman, A. H ...; Anand, Sonia S.; Balmforth, Antho ...; Berenson, Gerald ...; Bezzina, Connie ...; Boehm, Bernhard ...; Boerwinkle, Eric; Casas, Juan P.; Caulfield, Mark ...; Clarke, Robert; Connell, John M.; Cruickshanks, Ka ...; Davidson, Karina ...; Day, Ian N. M.; de Bakker, Paul ...; Doevendans, Piet ...; Dominiczak, Anna ...; Hall, Alistair S ...; Hartman, Cathari ...; Hengstenberg, Ch ...; Hillege, Hans L.; Hofker, Marten H ...; Humphries, Steve ...; Jarvik, Gail P.; Johnson, Julie A ...; Kaess, Bernhard ...; Kathiresan, Seka ...; Koenig, Wolfgang; Lawlor, Debbie A ...; Maerz, Winfried; Melander, Olle; Mitchell, Braxto ...; Montgomery, Gran ...; Munroe, Patricia ...; Murray, Sarah S.; Newhouse, Stephe ...; Onland-Moret, N. ...; Poulter, Neil; Psaty, Bruce; Redline, Susan; Rich, Stephen S.; Rotter, Jerome I ...; Schunkert, Herib ...; Sever, Peter; Shuldiner, Alan ...; Silverstein, Roy ...; Stanton, Alice; Thorand, Barbara; Trip, Mieke D.; Tsai, Michael Y.; van der Harst, P ...; van der Schoot, ...; van der Schouw, ...; Verschuren, W. M ...; Watkins, Hugh; Wilde, Arthur A. ...; Wolffenbuttel, B ...; Whitfield, John ...; Hovingh, G. Kees; Ballantyne, Chri ...; Wijmenga, Cisca; Reilly, Muredach ...; Martin, Nicholas ...; Wilson, James G.; Rader, Daniel J.; Samani, Nilesh J ...; Reiner, Alex P.; Hegele, Robert A ...; Kastelein, John ...; Hingorani, Aroon ...; Talmud, Philippa ...; Hakonarson, Hako ...; Elbers, Clara C.; Keating, Brendan ...; Drenos, Fotios; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: American Journal ...

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se