SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Morganella Sandro)
 

Sökning: WFRF:(Morganella Sandro) > A practical framewo...

  • Degasperi, AndreaAddenbrooke's Hospital,Wellcome Trust Sanger Institute (författare)

A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-02-17
  • Springer Science and Business Media LLC,2020
  • 15 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:715644a1-67d8-440f-924a-dfad70a7dfeb
  • https://lup.lub.lu.se/record/715644a1-67d8-440f-924a-dfad70a7dfebURI
  • https://doi.org/10.1038/s43018-020-0027-5DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Mutational signatures are patterns of mutations that arise during tumorigenesis. We present an enhanced, practical framework for mutational signature analyses. Applying these methods to 3,107 whole-genome-sequenced (WGS) primary cancers of 21 organs reveals known signatures and nine previously undescribed rearrangement signatures. We highlight interorgan variability of signatures and present a way of visualizing that diversity, reinforcing our findings in an independent analysis of 3,096 WGS metastatic cancers. Signatures with a high level of genomic instability are dependent on TP53 dysregulation. We illustrate how uncertainty in mutational signature identification and assignment to samples affects tumor classification, reinforcing that using multiple orthogonal mutational signature data is not only beneficial, but is also essential for accurate tumor stratification. Finally, we present a reference web-based tool for cancer and experimentally generated mutational signatures, called Signal (https://signal.mutationalsignatures.com), that also supports performing mutational signature analyses.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Amarante, Tauanne DiasAddenbrooke's Hospital,Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Czarnecki, JanWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Shooter, ScottWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Glodzik, DominikLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,Wellcome Trust Sanger Institute,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center(Swepub:lu)do5123gl (författare)
  • Morganella, SandroWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Nanda, Arjun S.Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Badja, CherifWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Koh, GeneWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Momen, Sophie E.Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Georgakopoulos-Soares, IliasWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Dias, João M.L. (författare)
  • Young, JamieAddenbrooke's Hospital,Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Memari, YasinAddenbrooke's Hospital (författare)
  • Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Nik-Zainal, SerenaWellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital (författare)
  • Addenbrooke's HospitalWellcome Trust Sanger Institute (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Cancer: Springer Science and Business Media LLC1:2, s. 249-2632662-1347

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy