SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lascorz Jesus)
 

Sökning: WFRF:(Lascorz Jesus) > Schafmayer Clemens > Rahner Nils > Genome-wide associa...

  • Lascorz, Jesus (författare)

Genome-wide association study for colorectal cancer identifies risk polymorphisms in German familial cases and implicates MAPK signalling pathways in disease susceptibility

  • Artikel/kapitelEngelska2010

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2010-07-07
  • Oxford University Press (OUP),2010

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:c402e24f-dc8c-4070-a274-6a05903ca9b6
  • https://lup.lub.lu.se/record/1697835URI
  • https://doi.org/10.1093/carcin/bgq146DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Genetic susceptibility accounts for similar to 35% of all colorectal cancer (CRC). Ten common low-risk variants contributing to CRC risk have been identified through genome-wide association studies (GWASs). In our GWAS, 610 664 genotyped single-nucleotide polymorphisms (SNPs) passed the quality control filtering in 371 German familial CRC patients and 1263 controls, and replication studies were conducted in four additional case-control sets (4915 cases and 5607 controls). Known risk loci at 8q24.21 and 11q23 were confirmed, and a previously unreported association, rs12701937, located between the genes GLI3 (GLI family zinc finger 3) and INHBA (inhibin, beta A) [P = 1.1 x 10(-3), odds ratio (OR) 1.14, 95% confidence interval (CI) 1.05-1.23, dominant model in the combined cohort], was identified. The association was stronger in familial cases compared with unselected cases (P = 2.0 x 10(-4), OR 1.36, 95% CI 1.16-1.60, dominant model). Two other unreported SNPs, rs6038071, 40 kb upstream of CSNK2A1 (casein kinase 2, alpha 1 polypeptide) and an intronic marker in MYO3A (myosin IIIA), rs11014993, associated with CRC only in the familial CRC cases (P = 2.5 x 10(-3), recessive model, and P = 2.7 x 10(-4), dominant model). Three software tools successfully pointed to the overrepresentation of genes related to the mitogen-activated protein kinase (MAPK) signalling pathways among the 1340 most strongly associated markers from the GWAS (allelic P value < 10(-3)). The risk of CRC increased significantly with an increasing number of risk alleles in seven genes involved in MAPK signalling events (P-trend = 2.2 x 10(-16), ORper allele = 1.34, 95% CI 1.11-1.61).

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Försti, AstaLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-asf (författare)
  • Chen, Bowang (författare)
  • Buch, Stephan (författare)
  • Steinke, Verena (författare)
  • Rahner, Nils (författare)
  • Holinski-Feder, Elke (författare)
  • Morak, Monika (författare)
  • Schackert, Hans K. (författare)
  • Goergens, Heike (författare)
  • Schulmann, Karsten (författare)
  • Goecke, Timm (författare)
  • Kloor, Matthias (författare)
  • Engel, Cristoph (författare)
  • Buettner, Reinhard (författare)
  • Kunkel, Nelli (författare)
  • Weires, Marianne (författare)
  • Hoffmeister, Michael (författare)
  • Pardini, Barbara (författare)
  • Naccarati, Alessio (författare)
  • Vodickova, Ludmila (författare)
  • Novotny, Jan (författare)
  • Schreiber, Stefan (författare)
  • Krawczak, Michael (författare)
  • Broering, Clemens D. (författare)
  • Voelzke, Henry (författare)
  • Schafmayer, Clemens (författare)
  • Vodicka, Pavel (författare)
  • Chang-Claude, Jenny (författare)
  • Brenner, Hermann (författare)
  • Burwinkel, Barbara (författare)
  • Propping, Peter (författare)
  • Hampe, Jochen (författare)
  • Hemminki, KariLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-khk (författare)
  • Allmänmedicin och klinisk epidemiologiForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Carcinogenesis: Oxford University Press (OUP)31:9, s. 1612-16190143-33341460-2180

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy