SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d6e1c590-8d73-413d-980e-0fa453c577f5"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d6e1c590-8d73-413d-980e-0fa453c577f5" > Discovery of Geneti...

  • Smith, GustavLund University,Lunds universitet,Kardiologi,Sektion II,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Heart Failure and Mechanical Support,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiology,Section II,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Department of Clinical Sciences, Malmö,Lund University Research Groups,Massachusetts General Hospital,Broad Institute (författare)

Discovery of Genetic Variation on Chromosome 5q22 Associated with Mortality in Heart Failure

  • Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-05-05
  • Public Library of Science (PLoS),2016

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:d6e1c590-8d73-413d-980e-0fa453c577f5
  • https://lup.lub.lu.se/record/d6e1c590-8d73-413d-980e-0fa453c577f5URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006034DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Failure of the human heart to maintain sufficient output of blood for the demands of the body, heart failure, is a common condition with high mortality even with modern therapeutic alternatives. To identify molecular determinants of mortality in patients with new-onset heart failure, we performed a meta-analysis of genome-wide association studies and follow-up genotyping in independent populations. We identified and replicated an association for a genetic variant on chromosome 5q22 with 36% increased risk of death in subjects with heart failure (rs9885413, P = 2.7x10-9). We provide evidence from reporter gene assays, computational predictions and epigenomic marks that this polymorphism increases activity of an enhancer region active in multiple human tissues. The polymorphism was further reproducibly associated with a DNA methylation signature in whole blood (P = 4.5x10-40) that also associated with allergic sensitization and expression in blood of the cytokine TSLP (P = 1.1x10-4). Knockdown of the transcription factor predicted to bind the enhancer region (NHLH1) in a human cell line (HEK293) expressing NHLH1 resulted in lower TSLP expression. In addition, we observed evidence of recent positive selection acting on the risk allele in populations of African descent. Our findings provide novel genetic leads to factors that influence mortality in patients with heart failure.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Felix, Janine F.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Morrison, Alanna C.University of Texas (författare)
  • Kalogeropoulos, AndreasEmory Clinic (författare)
  • Trompet, StellaLeiden University Medical Centre (författare)
  • Wilk, Jemma B.Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (författare)
  • Gidlöf, OlofLund University,Lunds universitet,Kardiologi,Sektion II,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Cardiology,Section II,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-ogf (författare)
  • Wang, XinchenMassachusetts Institute of Technology (författare)
  • Morley, MichaelUniversity of Pennsylvania (författare)
  • Mendelson, MichaelBoston Children's Hospital (författare)
  • Joehanes, RobyNational Heart Lung and Blood Institute (författare)
  • Ligthart, SymenErasmus University Medical Center (författare)
  • Shan, XiaoyinUniversity of Pennsylvania (författare)
  • Bis, Joshua C.University of Washington (författare)
  • Wang, Ying A.Novartis Institutes for BioMedical Research, Inc. (författare)
  • Sjögren, MarketaLund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Malmö,Faculty of Medicine(Swepub:lu)endo-msj (författare)
  • Ngwa, JuliusBoston University (författare)
  • Brandimarto, JeffreyUniversity of Pennsylvania (författare)
  • Stott, David J.University of Glasgow (författare)
  • Aguilar, DavidBaylor College of Medicine (författare)
  • Rice, Kenneth M.University of Washington (författare)
  • Sesso, Howard D.Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (författare)
  • Demissie, SerkalemBoston University (författare)
  • Buckley, Brendan M.University College Cork (författare)
  • Taylor, Kent D.University of California, Los Angeles (författare)
  • Ford, IanUniversity of Glasgow (författare)
  • Yao, ChenNational Heart Lung and Blood Institute (författare)
  • Liu, ChunyuNational Heart Lung and Blood Institute (författare)
  • Sotoodehnia, NonaUniversity of Washington (författare)
  • van der Harst, PimUniversity of Groningen (författare)
  • Stricker, Bruno H ChErasmus University Medical Center (författare)
  • Kritchevsky, Stephen B.Wake Forest University (författare)
  • Liu, YongmeiWake Forest University (författare)
  • Gaziano, J. MichaelBrigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (författare)
  • Hofman, AlbertErasmus University Medical Center (författare)
  • Moravec, Christine S.Cleveland Clinic Foundation (författare)
  • Uitterlinden, André G.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Kellis, ManolisMassachusetts Institute of Technology (författare)
  • van Meurs, Joyce B.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Margulies, Kenneth B.University of Pennsylvania (författare)
  • Dehghan, AbbasErasmus University Medical Center (författare)
  • Levy, DanielNational Heart Lung and Blood Institute (författare)
  • Olde, BjörnLund University,Lunds universitet,Kardiologi,Sektion II,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Cardiology,Section II,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)mphy-bol (författare)
  • Psaty, Bruce M.Kaiser Permanente Research Institute (författare)
  • Cupples, L. AdrienneBoston University (författare)
  • Jukema, J. WouterInteruniversity Cardiology Institute of the Netherlands (författare)
  • Djousse, LucBrigham and Women's Hospital / Harvard Medical School (författare)
  • Franco, Oscar H.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Boerwinkle, EricBaylor College of Medicine (författare)
  • Boyer, Laurie A.Massachusetts Institute of Technology (författare)
  • Newton-Cheh, ChristopherMassachusetts General Hospital (författare)
  • Butler, JavedEmory Clinic (författare)
  • Vasan, Ramachandran S.Boston University (författare)
  • Cappola, Thomas P.University of Pennsylvania (författare)
  • Smith, Nicholas L.Veterans Health Administration Office of Research and Development (författare)
  • KardiologiSektion II (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)12:51553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy