SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Weischenfeldt J)
 

Sökning: WFRF:(Weischenfeldt J) > Pan-cancer analysis...

Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition

Rodriguez-Martin, B (författare)
University of Santiago de Compostela
Alvarez, EG (författare)
University of Santiago de Compostela
Baez-Ortega, A (författare)
University of Cambridge
visa fler...
Zamora, J (författare)
University of Santiago de Compostela
Supek, F (författare)
Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)
Demeulemeester, J (författare)
Francis Crick Institute
Santamarina, M (författare)
University of Santiago de Compostela
Ju, YS (författare)
Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)
Temes, J (författare)
University of Santiago de Compostela
Garcia-Souto, D (författare)
University of Santiago de Compostela
Detering, H (författare)
University of Vigo
Li, YL (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Rodriguez-Castro, J (författare)
University of Santiago de Compostela
Dueso-Barroso, A (författare)
University of Vic
Bruzos, AL (författare)
University of Santiago de Compostela
Dentro, SC (författare)
Francis Crick Institute
Blanco, MG (författare)
University of Santiago de Compostela,Yale University
Contino, G (författare)
University of Cambridge
Ardeljan, D (författare)
Johns Hopkins University
Tojo, M (författare)
University of Vigo
Roberts, ND (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Zumalave, S (författare)
University of Santiago de Compostela
Edwards, PAW (författare)
University of Cambridge
Weischenfeldt, J (författare)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
Puiggros, M (författare)
Centro Nacional de Supercomputación
Chong, ZC (författare)
University of Texas
Chen, K (författare)
University of Texas MD Anderson Cancer Center
Lee, EA (författare)
Harvard Medical School
Wala, JA (författare)
Broad Institute
Raine, K (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Butler, A (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Waszak, SM (författare)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
Navarro, FCP (författare)
Yale University
Schumacher, SE (författare)
Broad Institute
Monlong, J (författare)
McGill University,University of Santiago de Compostela
Maura, F (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Bolli, N (författare)
University of Milan
Bourque, G (författare)
McGill University
Gerstein, M (författare)
Park, PJ (författare)
Harvard Medical School
Wedge, DC (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Beroukhim, R (författare)
Broad Institute
Torrents, D (författare)
Catalan Institution for Research and Advanced Studies
Korbel, JO (författare)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
Martincorena, I (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Fitzgerald, RC (författare)
University of Cambridge
Van Loo, P (författare)
Francis Crick Institute
Kazazian, HH (författare)
Johns Hopkins University
Burns, KH (författare)
Johns Hopkins University
Campbell, PJ (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Tubio, JMC (författare)
Akdemir, KC (författare)
Boutros, PC (författare)
Bowtell, DDL (författare)
Brors, B (författare)
Chan, K (författare)
Cortes-Ciriano, I (författare)
Dunford, AJ (författare)
Edwards, PA (författare)
Estivill, X (författare)
Etemadmoghadam, D (författare)
Feuerbach, L (författare)
Fink, JL (författare)
Frenkel-Morgenstern, M (författare)
Garsed, DW (författare)
Gordenin, DA (författare)
Haan, D (författare)
Haber, JE (författare)
Hess, JM (författare)
Hutter, B (författare)
Imielinski, M (författare)
Jones, DTW (författare)
Kazanov, MD (författare)
Klimczak, LJ (författare)
Koh, Y (författare)
Kumar, K (författare)
Lee, JJK (författare)
Lynch, AG (författare)
Macintyre, G (författare)
Markowetz, F (författare)
Martinez-Fundichely, A (författare)
Meyerson, M (författare)
Miyano, S (författare)
Nakagawa, H (författare)
Ossowski, S (författare)
Pearson, JV (författare)
Rippe, K (författare)
Roberts, SA (författare)
Scully, R (författare)
Shackleton, M (författare)
Sidiropoulos, N (författare)
Sieverling, L (författare)
Stewart, C (författare)
Villasante, I (författare)
Waddell, N (författare)
Yang, LX (författare)
Yao, XT (författare)
Yoon, SS (författare)
Zhang, CZ (författare)
Borg, Åke (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
Ringnér, Markus (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
Staaf, Johan (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2020-02-05
2020
Engelska.
Ingår i: Nature genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1546-1718 .- 1061-4036. ; 52:3, s. 306-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • About half of all cancers have somatic integrations of retrotransposons. Here, to characterize their role in oncogenesis, we analyzed the patterns and mechanisms of somatic retrotransposition in 2,954 cancer genomes from 38 histological cancer subtypes within the framework of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) project. We identified 19,166 somatically acquired retrotransposition events, which affected 35% of samples and spanned a range of event types. Long interspersed nuclear element (LINE-1; L1 hereafter) insertions emerged as the first most frequent type of somatic structural variation in esophageal adenocarcinoma, and the second most frequent in head-and-neck and colorectal cancers. Aberrant L1 integrations can delete megabase-scale regions of a chromosome, which sometimes leads to the removal of tumor-suppressor genes, and can induce complex translocations and large-scale duplications. Somatic retrotranspositions can also initiate breakage–fusion–bridge cycles, leading to high-level amplification of oncogenes. These observations illuminate a relevant role of 22 L1 retrotransposition in remodeling the cancer genome, with potential implications for the development of human tumors.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Nyckelord

Carcinogenesis/genetics
Gene Rearrangement/genetics
Genome, Human/genetics
Humans
Long Interspersed Nucleotide Elements/genetics
Neoplasms/genetics
Retroelements/genetics

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy