SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Zamani Neda)
 

Sökning: WFRF:(Zamani Neda) > Serendipitous Meta-...

Serendipitous Meta-Transcriptomics : The Fungal Community of Norway Spruce (Picea abies)

Delhomme, Nicolas (författare)
Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)
Sundström, Görel (författare)
Uppsala universitet,Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Uppsala Univ, Dept Med Biochem & Microbiol, Sci Life Lab, Uppsala, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Zamani, Neda (författare)
Uppsala universitet,Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Uppsala Univ, Dept Med Biochem & Microbiol, Sci Life Lab, Uppsala, Sweden,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
visa fler...
Lantz, Henrik (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Lin, Yao-Cheng (författare)
Hvidsten, Torgeir R. (författare)
Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Norwegian Univ Life Sci, Dept Chem Biotechnol & Food Sci, As, Norway
Höppner, Marc P. (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräknings- och systembiologi
Jern, Patric (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Van de Peer, Yves (författare)
Lundeberg, Joakim (författare)
KTH,Genteknologi
Grabherr, Manfred G. (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Street, Nathaniel R. (författare)
Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2015-09-28
2015
Engelska.
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 10:9
Relaterad länk:
https://doi.org/10.1...
visa fler...
https://journals.plo...
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
https://urn.kb.se/re...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • After performing de novo transcript assembly of >1 billion RNA-Sequencing reads obtained from 22 samples of different Norway spruce (Picea abies) tissues that were not surface sterilized, we found that assembled sequences captured a mix of plant, lichen, and fungal transcripts. The latter were likely expressed by endophytic and epiphytic symbionts, indicating that these organisms were present, alive, and metabolically active. Here, we show that these serendipitously sequenced transcripts need not be considered merely as contamination, as is common, but that they provide insight into the plant's phyllosphere. Notably, we could classify these transcripts as originating predominantly from Dothideomycetes and Leotiomycetes species, with functional annotation of gene families indicating active growth and metabolism, with particular regards to glucose intake and processing, as well as gene regulation.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
LANTBRUKSVETENSKAPER  -- Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske (hsv//swe)
AGRICULTURAL SCIENCES  -- Agriculture, Forestry and Fisheries (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy