SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"20194187"
 

Sökning: onr:"20194187" > Exome sequencing of...

  • Elvers, Ingegerd (författare)

Exome sequencing of lymphomas from three dog breeds reveals somatic mutation patterns reflecting genetic background

  • E-artikel/E-kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2015

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:20194187
  • http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-268799uri
  • urn:nbn:se:uu:diva-268799urn
  • 10.1101/gr.194449.115doi

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Anmärkningar

  • Published
  • NIH (National Institute of Health) [U54 HG003067-08]
  • EU, Europeiska forskningsrådet
  • Vetenskapsrådet
  • EU, Europeiska forskningsrådet
  • gratis
  • Lymphoma is the most common hematological malignancy in developed countries. Outcome is strongly determined by molecular subtype, reflecting a need for new and improved treatment options. Dogs spontaneously develop lymphoma, and the predisposition of certain breeds indicates genetic risk factors. Using the dog breed structure, we selected three lymphoma predisposed breeds developing primarily T-cell (boxer), primarily B-cell (cocker spaniel), and with equal distribution of B- and T-cell lymphoma (golden retriever), respectively. We investigated the somatic mutations in B- and T-cell lymphomas from these breeds by exome sequencing of tumor and normal pairs. Strong similarities were evident between B-cell lymphomas from golden retrievers and cocker spaniels, with recurrent mutations in TRAF3-MAP3K14 (28% of all cases), FBXW7 (25%), and POT1 (17%). The FBXW7 mutations recurrently occur in a specific codon; the corresponding codon is recurrently mutated in human cancer. In contrast, T-cell lymphomas from the predisposed breeds, boxers and golden retrievers, show little overlap in their mutation pattern, sharing only one of their 15 most recurrently mutated genes. Boxers, which develop aggressive T-cell lymphomas, are typically mutated in the PTEN-mTOR pathway. T-cell lymphomas in golden retrievers are often less aggressive, and their tumors typically showed mutations in genes involved in cellular metabolism. We identify genes with known involvement in human lymphoma and leukemia, genes implicated in other human cancers, as well as novel genes that could allow new therapeutic options.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Turner-Maier, Jason (författare)
  • Swofford, Ross (författare)
  • Koltookian, Michele (författare)
  • Johnson, Jeremy (författare)
  • Stewart, Chip (författare)
  • Zhang, Cheng-Zhong (författare)
  • Schumacher, Steven E. (författare)
  • Beroukhim, Rameen (författare)
  • Rosenberg, Mara (författare)
  • Thomas, Rachael (författare)
  • Mauceli, Evan (författare)
  • Getz, Gad (författare)
  • Di Palma, Federica (författare)
  • Modiano, Jaime F. (författare)
  • Breen, Matthew (författare)
  • Lindblad-Toh, Kerstin268427 (författare)
  • Alfoeldi, Jessica (författare)
  • Uppsala universitetMedicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)

Sammanhörande titlar

  • Del av/supplement till:channel record
  • Ingår i:VärdpublikationGenome Research25:11, 1634-16451088-9051

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy