Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-158571" >
Transcriptome-Wide ...
-
Atkins, Isabelle
(författare)
Transcriptome-Wide Association Study Identifies New Candidate Susceptibility Genes for Glioma
- Artikel/kapitelEngelska2019
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
American Association for Cancer Research,2019
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-158571
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-158571URI
-
https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-18-2888DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Genome-wide association studies (GWAS) have so far identified 25 loci associated with glioma risk, with most showing specificity for either glioblastoma (GBM) or non-GBM tumors. The majority of these GWAS susceptibility variants reside in noncoding regions and the causal genes underlying the associations are largely unknown. Here we performed a transcriptome-wide association study to search for novel risk loci and candidate causal genes at known GWAS loci using Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) data to predict cis-predicted gene expression in relation to GBM and non-GBM risk in conjunction with GWAS summary statistics on 12,488 glioma cases (6,183 GBM and 5,820 non-GBM) and 18,169 controls. Imposing a Bonferroni-corrected significance level of P < 5.69 x 10(-6), candidate novel risk locus for GBM (mean Z = 4.43; P = 5.68 x 10(-6)). GALNT6 resides at least 55 Mb away from any previously identified glioma risk variant, while all other 30 significantly associated genes were located within 1 Mb of known GWAS-identified loci and were not significant after conditioning on the known GWAS-identified variants. These data identify a novel locus (GALNT6 at 12q13.33) and 30 genes at 12 known glioma risk loci associated with glioma risk, providing further insights into glioma tumorigenesis.Significance: This study identifies new genes associated with glioma risk, increasing understanding of how these tumors develop.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Kinnersley, Ben
(författare)
-
Ostrom, Quinn T.
(författare)
-
Labreche, Karim
(författare)
-
Il'yasova, Dora
(författare)
-
Armstrong, Georgina N.
(författare)
-
Eckel-Passow, Jeanette E.
(författare)
-
Schoemaker, Minouk J.
(författare)
-
Nothen, Markus M.
(författare)
-
Barnholtz-Sloan, Jill S.
(författare)
-
Swerdlow, Anthony J.
(författare)
-
Simon, Matthias
(författare)
-
Rajaraman, Preetha
(författare)
-
Chanock, Stephen J.
(författare)
-
Shildkraut, Joellen
(författare)
-
Bernstein, Jonine L.
(författare)
-
Hoffman, Per
(författare)
-
Jockel, Karl-Heinz
(författare)
-
Lai, Rose K.
(författare)
-
Claus, Elizabeth B.
(författare)
-
Olson, Sara H.
(författare)
-
Johansen, Christoffer
(författare)
-
Wrensch, Margaret R.
(författare)
-
Melin, Beatrice S.Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)bema0010
(författare)
-
Jenkins, Robert B.
(författare)
-
Sanson, Marc
(författare)
-
Bondy, Melissa L.
(författare)
-
Houlston, Richard S.
(författare)
-
Umeå universitetOnkologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Cancer Research: American Association for Cancer Research79:8, s. 2065-20710008-54721538-7445
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Atkins, Isabelle
-
Kinnersley, Ben
-
Ostrom, Quinn T.
-
Labreche, Karim
-
Il'yasova, Dora
-
Armstrong, Georg ...
-
visa fler...
-
Eckel-Passow, Je ...
-
Schoemaker, Mino ...
-
Nothen, Markus M ...
-
Barnholtz-Sloan, ...
-
Swerdlow, Anthon ...
-
Simon, Matthias
-
Rajaraman, Preet ...
-
Chanock, Stephen ...
-
Shildkraut, Joel ...
-
Bernstein, Jonin ...
-
Hoffman, Per
-
Jockel, Karl-Hei ...
-
Lai, Rose K.
-
Claus, Elizabeth ...
-
Olson, Sara H.
-
Johansen, Christ ...
-
Wrensch, Margare ...
-
Melin, Beatrice ...
-
Jenkins, Robert ...
-
Sanson, Marc
-
Bondy, Melissa L ...
-
Houlston, Richar ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Cancer Research
- Av lärosätet
-
Umeå universitet