SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-96520"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-96520" > Genome-wide interac...

  • Figueroa, Jonine D. (författare)

Genome-wide interaction study of smoking and bladder cancer risk

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2014-03-24
  • Oxford University Press,2014
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-96520
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-96520URI
  • https://doi.org/10.1093/carcin/bgu064DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:129950353URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Bladder cancer is a complex disease with known environmental and genetic risk factors. We performed a genome-wide interaction study (GWAS) of smoking and bladder cancer risk based on primary scan data from 3002 cases and 4411 controls from the National Cancer Institute Bladder Cancer GWAS. Alternative methods were used to evaluate both additive and multiplicative interactions between individual single nucleotide polymorphisms (SNPs) and smoking exposure. SNPs with interaction P values < 5 x 10(-5) were evaluated further in an independent dataset of 2422 bladder cancer cases and 5751 controls. We identified 10 SNPs that showed association in a consistent manner with the initial dataset and in the combined dataset, providing evidence of interaction with tobacco use. Further, two of these novel SNPs showed strong evidence of association with bladder cancer in tobacco use subgroups that approached genome-wide significance. Specifically, rs1711973 (FOXF2) on 6p25.3 was a susceptibility SNP for never smokers [combined odds ratio (OR) = 1.34, 95% confidence interval (CI) = 1.20-1.50, P value = 5.18 x 10(-7)]; and rs12216499 (RSPH3-TAGAP-EZR) on 6q25.3 was a susceptibility SNP for ever smokers (combined OR = 0.75, 95% CI = 0.67-0.84, P value = 6.35 x 10-7). In our analysis of smoking and bladder cancer, the tests for multiplicative interaction seemed to more commonly identify susceptibility loci with associations in never smokers, whereas the additive interaction analysis identified more loci with associations among smokers-including the known smoking and NAT2 acetylation interaction. Our findings provide additional evidence of gene-environment interactions for tobacco and bladder cancer.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Han, Summer S. (författare)
  • Garcia-Closas, Montserrat (författare)
  • Baris, Dalsu (författare)
  • Jacobs, Eric J. (författare)
  • Kogevinas, Manolis (författare)
  • Schwenn, Molly (författare)
  • Malats, Nuria (författare)
  • Johnson, Alison (författare)
  • Purdue, Mark P. (författare)
  • Caporaso, Neil (författare)
  • Landi, Maria Teresa (författare)
  • Prokunina-Olsson, Ludmila (författare)
  • Wang, Zhaoming (författare)
  • Hutchinson, Amy (författare)
  • Burdette, Laurie (författare)
  • Wheeler, William (författare)
  • Vineis, Paolo (författare)
  • Siddiq, Afshan (författare)
  • Cortessis, Victoria K. (författare)
  • Kooperberg, Charles (författare)
  • Cussenot, Olivier (författare)
  • Benhamou, Simone (författare)
  • Prescott, Jennifer (författare)
  • Porru, Stefano (författare)
  • Bueno-de-Mesquita, H. Bas (författare)
  • Trichopoulos, Dimitrios (författare)
  • Ljungberg, BörjeUmeå universitet,Urologi och andrologi,Njurcancer(Swepub:umu)bolj0001 (författare)
  • Clavel-Chapelon, Françoise (författare)
  • Weiderpass, ElisabeteKarolinska Institutet (författare)
  • Krogh, Vittorio (författare)
  • Dorronsoro, Miren (författare)
  • Travis, Ruth (författare)
  • Tjønneland, Anne (författare)
  • Brenan, Paul (författare)
  • Chang-Claude, Jenny (författare)
  • Riboli, Elio (författare)
  • Conti, David (författare)
  • Gago-Dominguez, Manuela (författare)
  • Stern, Mariana C. (författare)
  • Pike, Malcolm C. (författare)
  • Van den Berg, David (författare)
  • Yuan, Jian-Min (författare)
  • Hohensee, Chancellor (författare)
  • Rodabough, Rebecca (författare)
  • Cancel-Tassin, Geraldine (författare)
  • Roupret, Morgan (författare)
  • Comperat, Eva (författare)
  • Chen, Constance (författare)
  • De Vivo, Immaculata (författare)
  • Giovannucci, Edward (författare)
  • Hunter, David J. (författare)
  • Kraft, Peter (författare)
  • Lindstrom, Sara (författare)
  • Carta, Angela (författare)
  • Pavanello, Sofia (författare)
  • Arici, Cecilia (författare)
  • Mastrangelo, Giuseppe (författare)
  • Karagas, Margaret R. (författare)
  • Schned, Alan (författare)
  • Armenti, Karla R. (författare)
  • Hosain, G. M. Monawar (författare)
  • Haiman, Chris A. (författare)
  • Fraumeni, Joseph F., Jr. (författare)
  • Chanock, Stephen J. (författare)
  • Chatterjee, Nilanjan (författare)
  • Rothman, Nathaniel (författare)
  • Silverman, Debra T. (författare)
  • Umeå universitetUrologi och andrologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Carcinogenesis: Oxford University Press35:8, s. 1737-17440143-33341460-2180

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Figueroa, Jonine ...
Han, Summer S.
Garcia-Closas, M ...
Baris, Dalsu
Jacobs, Eric J.
Kogevinas, Manol ...
visa fler...
Schwenn, Molly
Malats, Nuria
Johnson, Alison
Purdue, Mark P.
Caporaso, Neil
Landi, Maria Ter ...
Prokunina-Olsson ...
Wang, Zhaoming
Hutchinson, Amy
Burdette, Laurie
Wheeler, William
Vineis, Paolo
Siddiq, Afshan
Cortessis, Victo ...
Kooperberg, Char ...
Cussenot, Olivie ...
Benhamou, Simone
Prescott, Jennif ...
Porru, Stefano
Bueno-de-Mesquit ...
Trichopoulos, Di ...
Ljungberg, Börje
Clavel-Chapelon, ...
Weiderpass, Elis ...
Krogh, Vittorio
Dorronsoro, Mire ...
Travis, Ruth
Tjønneland, Anne
Brenan, Paul
Chang-Claude, Je ...
Riboli, Elio
Conti, David
Gago-Dominguez, ...
Stern, Mariana C ...
Pike, Malcolm C.
Van den Berg, Da ...
Yuan, Jian-Min
Hohensee, Chance ...
Rodabough, Rebec ...
Cancel-Tassin, G ...
Roupret, Morgan
Comperat, Eva
Chen, Constance
De Vivo, Immacul ...
Giovannucci, Edw ...
Hunter, David J.
Kraft, Peter
Lindstrom, Sara
Carta, Angela
Pavanello, Sofia
Arici, Cecilia
Mastrangelo, Giu ...
Karagas, Margare ...
Schned, Alan
Armenti, Karla R ...
Hosain, G. M. Mo ...
Haiman, Chris A.
Fraumeni, Joseph ...
Chanock, Stephen ...
Chatterjee, Nila ...
Rothman, Nathani ...
Silverman, Debra ...
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Cancer och onkol ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Urologi och njur ...
Artiklar i publikationen
Carcinogenesis
Av lärosätet
Umeå universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy