DNA Methylation Analysis of Bone Marrow Cells at Diagnosis of Acute Lymphoblastic Leukemia and at Remission

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-178755" > DNA Methylation Ana...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Nordlund, JessicaUppsala universitet,Molekylär medicin (författare)

DNA Methylation Analysis of Bone Marrow Cells at Diagnosis of Acute Lymphoblastic Leukemia and at Remission

Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2012-04-06
Public Library of Science (PLoS),2012
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-178755
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-178755URI
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0034513DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

To detect genes with CpG sites that display methylation patterns that are characteristic of acute lymphoblastic leukemia (ALL) cells, we compared the methylation patterns of cells taken at diagnosis from 20 patients with pediatric ALL to the methylation patterns in mononuclear cells from bone marrow of the same patients during remission and in non-leukemic control cells from bone marrow or blood. Using a custom-designed assay, we measured the methylation levels of 1,320 CpG sites in regulatory regions of 413 genes that were analyzed because they display allele-specific gene expression (ASE) in ALL cells. The rationale for our selection of CpG sites was that ASE could be the result of allele-specific methylation in the promoter regions of the genes. We found that the ALL cells had methylation profiles that allowed distinction between ALL cells and control cells. Using stringent criteria for calling differential methylation, we identified 28 CpG sites in 24 genes with recurrent differences in their methylation levels between ALL cells and control cells. Twenty of the differentially methylated genes were hypermethylated in the ALL cells, and as many as nine of them (AMICA1, CPNE7, CR1, DBC1, EYA4, LGALS8, RYR3, UQCRFS1, WDR35) have functions in cell signaling and/or apoptosis. The methylation levels of a subset of the genes were consistent with an inverse relationship with the mRNA expression levels in a large number of ALL cells from published data sets, supporting a potential biological effect of the methylation signatures and their application for diagnostic purposes.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Hematologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Hematology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Cancer och onkologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Cancer and Oncology hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Milani, LiliUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)livoj956 (författare)
Lundmark, AndersUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)andlu294 (författare)
Lönnerholm, Gudmar,1941-Uppsala universitet,Institutionen för kvinnors och barns hälsa,Barnonkologisk forskning/Pfeifer(Swepub:uu)gudmarlh (författare)
Syvänen, Ann-ChristineUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)anncsyva (författare)
Uppsala universitetMolekylär medicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)7:4, s. e34513-1932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Nordlund, Jessic ...; Milani, Lili; Lundmark, Anders; Lönnerholm, Gudm ...; Syvänen, Ann-Chr ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Hematologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Artiklar i publikationen: PLOS ONE

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se