Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-223057" >
A genome-wide asses...
-
Hong, Mun-Gwan
(författare)
A genome-wide assessment of variability in human serum metabolism
- Artikel/kapitelEngelska2013
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2013-03-05
-
Hindawi Limited,2013
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-223057
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-223057URI
-
https://doi.org/10.1002/humu.22267DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:126222919URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
The study of the genetic regulation of metabolism in human serum samples can contribute to a better understanding of the intermediate biological steps that lead from polymorphism to disease. Here, we conducted a genome-wide association study (GWAS) to discover metabolic quantitative trait loci (mQTLs) utilizing samples from a study of prostate cancer in Swedish men, consisting of 402 individuals (214 cases and 188 controls) in a discovery set and 489 case-only samples in a replication set. A global nontargeted metabolite profiling approach was utilized resulting in the detection of 6,138 molecular features followed by targeted identification of associated metabolites. Seven replicating loci were identified (PYROXD2, FADS1, PON1, CYP4F2, UGT1A8, ACADL, and LIPC) with associated sequence variants contributing significantly to trait variance for one or more metabolites (P = 10(-13) -10(-91)). Regional mQTL enrichment analyses implicated two loci that included FADS1 and a novel locus near PDGFC. Biological pathway analysis implicated ACADM, ACADS, ACAD8, ACAD10, ACAD11, and ACOXL, reflecting significant enrichment of genes with acyl-CoA dehydrogenase activity. mQTL SNPs and mQTL-harboring genes were over-represented across GWASs conducted to date, suggesting that these data may have utility in tracing the molecular basis of some complex disease associations.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Karlsson, RobertKarolinska Institutet
(författare)
-
Magnusson, Patrik K EKarolinska Institutet
(författare)
-
Lewis, Matthew R
(författare)
-
Isaacs, William
(författare)
-
Zheng, Lilly S
(författare)
-
Xu, Jianfeng
(författare)
-
Grönberg, HenrikKarolinska Institutet
(författare)
-
Ingelsson, Erik,1975-Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet(Swepub:uu)ering425
(författare)
-
Pawitan, YudiKarolinska Institutet
(författare)
-
Broeckling, Corey
(författare)
-
Prenni, Jessica E
(författare)
-
Wiklund, FredrikKarolinska Institutet
(författare)
-
Prince, Jonathan AKarolinska Institutet
(författare)
-
Karolinska InstitutetDepartment of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Human Mutation: Hindawi Limited34:3, s. 515-5241059-77941098-1004
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hong, Mun-Gwan
-
Karlsson, Robert
-
Magnusson, Patri ...
-
Lewis, Matthew R
-
Isaacs, William
-
Zheng, Lilly S
-
visa fler...
-
Xu, Jianfeng
-
Grönberg, Henrik
-
Ingelsson, Erik, ...
-
Pawitan, Yudi
-
Broeckling, Core ...
-
Prenni, Jessica ...
-
Wiklund, Fredrik
-
Prince, Jonathan ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Human Mutation
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet