Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-225006" >
Quality control and...
-
Winkler, Thomas W.
(författare)
Quality control and conduct of genome-wide association meta-analyses
- Artikel/kapitelEngelska2014
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2014-04-24
-
Springer Science and Business Media LLC,2014
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-225006
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-225006URI
-
https://doi.org/10.1038/nprot.2014.071DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:128761409URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Rigorous organization and quality control (QC) are necessary to facilitate successful genome-wide association meta-analyses (GWAMAs) of statistics aggregated across multiple genome-wide association studies. This protocol provides guidelines for (i) organizational aspects of GWAMAs, and for (ii) QC at the study file level, the meta- level across studies and the meta-analysis output level. Real-world examples highlight issues experienced and solutions developed by the GIANT Consortium that has conducted meta-analyses including data from 125 studies comprising more than 330,000 individuals. We provide a general protocol for conducting GWAMAs and carrying out QC to minimize errors and to guarantee maximum use of the data. We also include details for the use of a powerful and flexible software package called EasyQC. Precise timings will be greatly influenced by consortium size. For consortia of comparable size to the GIANT Consortium, this protocol takes a minimum of about 10 months to complete.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Day, Felix R.
(författare)
-
Croteau-Chonka, Damien C.
(författare)
-
Wood, Andrew R.
(författare)
-
Locke, Adam E.
(författare)
-
Maegi, Reedik
(författare)
-
Ferreira, Teresa
(författare)
-
Fall, ToveUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)tovfa878
(författare)
-
Graff, Mariaelisa
(författare)
-
Justice, Anne E.
(författare)
-
Luan, Jian'an
(författare)
-
Gustafsson, StefanUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)stegu732
(författare)
-
Randall, Joshua C.
(författare)
-
Vedantam, Sailaja
(författare)
-
Workalemahu, Tsegaselassie
(författare)
-
Kilpelainen, Tuomas O.
(författare)
-
Scherag, Andre
(författare)
-
Esko, Tonu
(författare)
-
Kutalik, Zoltan
(författare)
-
Heid, Iris M.
(författare)
-
Loos, Ruth J. F.
(författare)
-
Uppsala universitetMolekylär epidemiologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Protocols: Springer Science and Business Media LLC9:5, s. 1192-12121754-21891750-2799
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Winkler, Thomas ...
-
Day, Felix R.
-
Croteau-Chonka, ...
-
Wood, Andrew R.
-
Locke, Adam E.
-
Maegi, Reedik
-
visa fler...
-
Ferreira, Teresa
-
Fall, Tove
-
Graff, Mariaelis ...
-
Justice, Anne E.
-
Luan, Jian'an
-
Gustafsson, Stef ...
-
Randall, Joshua ...
-
Vedantam, Sailaj ...
-
Workalemahu, Tse ...
-
Kilpelainen, Tuo ...
-
Scherag, Andre
-
Esko, Tonu
-
Kutalik, Zoltan
-
Heid, Iris M.
-
Loos, Ruth J. F.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Protocols
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet