onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-258796"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-258796" > Quantitative Mass S...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Uebbing, SeverinUppsala universitet,Evolutionsbiologi (författare)
Quantitative Mass Spectrometry Reveals Partial Translational Regulation for Dosage Compensation in Chicken
- Artikel/kapitelEngelska2015
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2015-06-24
- Oxford University Press (OUP),2015
- electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-258796
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-258796URI
- https://doi.org/10.1093/molbev/msv147DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- There is increasing evidence that dosage compensation is not a ubiquitous feature following sex chromosome evolution, especially not in organisms where females are the heterogametic sex, like in birds. Even when it occurs, compensation can be incomplete and limited to dosage-sensitive genes. However, previous work has mainly studied transcriptional regulation of sex-linked genes, which may not reflect expression at the protein level. Here, we used liquid chromatography–tandem mass spectrometry to detect and quantify expressed levels of more than 2,400 proteins in ten different tissues of male and female chicken embryos. For comparison, transcriptome sequencing was performed in the same individuals, five of each sex. The proteomic analysis revealed that dosage compensation was incomplete, with a mean male-to-female (M:F) expression ratio of Z-linked genes of 1.32 across tissues, similar to that at the RNA level (1.29). The mean Z chromosome-to-autosome expression ratio was close to 1 in males and lower than 1 in females, consistent with partly reduced Z chromosome expression in females. Although our results exclude a general mechanism for chromosome-wide dosage compensation at translation, 30% of all proteins encoded from Z-linked genes showed a significant change in the M:F ratio compared with the corresponding ratio at the RNA level. This resulted in a pattern where some genes showed balanced expression between sexes and some close to 2-fold higher expression in males. This suggests that proteomic analyses will be necessary to reveal a more complete picture of gene regulation and sex chromosome evolution.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Biologi Evolutionsbiologi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Evolutionary Biology hsv//eng
- NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
- sex chromosome evolution
- dosage compensation
- chicken
- proteomics
- mass spectrometry
- Biology with specialization in Evolutionary Genetics
- Biologi med inriktning mot evolutionär genetik
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Konzer, AnneUppsala universitet,Analytisk kemi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)annko944 (författare)
- Xu, LuohaoUppsala universitet,Evolutionsbiologi (författare)
- Backström, NiclasUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)nibac839 (författare)
- Brunström, BjörnUppsala universitet,Miljötoxikologi(Swepub:uu)bjornbru (författare)
- Bergquist, JonasUppsala universitet,Analytisk kemi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)jbe25356 (författare)
- Ellegren, HansUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)hanselle (författare)
- Uppsala universitetEvolutionsbiologi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Molecular biology and evolution: Oxford University Press (OUP)32:10, s. 2716-27250737-40381537-1719
Internetlänk
- https://doi.org/10.1093/molbev/msv147Fulltext
- http://mbe.oxfordjournals.org/content/early/2015/07/08/molbev.msv147.full
- https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:842445/FULLTEXT01.pdffulltext:print
- https://academic.oup.com/mbe/article-pdf/32/10/2716/13166725/msv147.pdf
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-258796
- https://doi.org/10.1093/molbev/msv147
Hitta via bibliotek
- Molecular biology and evolution (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Uebbing, Severin
- Konzer, Anne
- Xu, Luohao
- Backström, Nicla ...
- Brunström, Björn
- Bergquist, Jonas
- visa fler...
- Ellegren, Hans
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Evolutionsbiolog ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Genetik
- Artiklar i publikationen
- Molecular biolog ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
