SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-319845"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-319845" > Mapping of 79 loci ...

  • Folkersen, Lasse (författare)

Mapping of 79 loci for 83 plasma protein biomarkers in cardiovascular disease

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-04-03
  • PUBLIC LIBRARY SCIENCE,2017
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-319845
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-319845URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006706DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:136007112URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Recent advances in highly multiplexed immunoassays have allowed systematic large-scale measurement of hundreds of plasma proteins in large cohort studies. In combination with genotyping, such studies offer the prospect to 1) identify mechanisms involved with regulation of protein expression in plasma, and 2) determine whether the plasma proteins are likely to be causally implicated in disease. We report here the results of genome-wide association (GWA) studies of 83 proteins considered relevant to cardiovascular disease (CVD), measured in 3,394 individuals with multiple CVD risk factors. We identified 79 genome-wide significant (p<5e-8) association signals, 55 of which replicated at P<0.0007 in separate validation studies (n = 2,639 individuals). Using automated text mining, manual curation, and network-based methods incorporating information on expression quantitative trait loci (eQTL), we propose plausible causal mechanisms for 25 trans-acting loci, including a potential post-translational regulation of stem cell factor by matrix metalloproteinase 9 and receptor-ligand pairs such as RANK-RANK ligand. Using public GWA study data, we further evaluate all 79 loci for their causal effect on coronary artery disease, and highlight several potentially causal associations. Overall, a majority of the plasma proteins studied showed evidence of regulation at the genetic level. Our results enable future studies of the causal architecture of human disease, which in turn should aid discovery of new drug targets.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • GENOME-WIDE ASSOCIATION; INTIMA-MEDIA THICKNESS; GENETIC-VARIANTS; MENDELIAN RANDOMIZATION; EXPRESSION; RISK; POPULATION; CELLS; GWAS; LIFE

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Fauman, Eric (författare)
  • Sabater-Lleal, MariaKarolinska Institutet (författare)
  • Strawbridge, Rona JKarolinska Institutet (författare)
  • Frånberg, Mattias (författare)
  • Sennblad, Bengt (författare)
  • Baldassarre, Damiano (författare)
  • Veglia, Fabrizio (författare)
  • Humphries, Steve E (författare)
  • Rauramaa, Rainer (författare)
  • de Faire, UlfKarolinska Institutet (författare)
  • Smit, Andries J (författare)
  • Giral, Philippe (författare)
  • Kurl, Sudhir (författare)
  • Mannarino, Elmo (författare)
  • Enroth, Stefan,1976-Uppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Gyllensten(Swepub:uu)stenr451 (författare)
  • Johansson, ÅsaUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)asjoh108 (författare)
  • Bosdotter Enroth, SofiaUppsala universitet,Kardiovaskulär epidemiologi(Swepub:uu)sofbo909 (författare)
  • Gustafsson, StefanUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)stegu732 (författare)
  • Lind, LarsUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär epidemiologi(Swepub:uu)larslind (författare)
  • Lindgren, Cecilia (författare)
  • Morris, Andrew P (författare)
  • Giedraitis, Vilmantas (författare)
  • Silveira, AngelaKarolinska Institutet (författare)
  • Franco-Cereceda, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Tremoli, Elena (författare)
  • Gyllensten, UlfUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ulfgyll (författare)
  • Ingelsson, Erik,1975-Uppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ering425 (författare)
  • Brunak, Søren (författare)
  • Eriksson, PerKarolinska Institutet (författare)
  • Ziemek, Daniel (författare)
  • Hamsten, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Mälarstig, AndersKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska InstitutetMedicinsk genetik och genomik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLOS Genetics: PUBLIC LIBRARY SCIENCE13:41553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy