Meta-analysis of gene-level tests for rare variant association.

The majority of reported complex disease associations for common genetic variants have been identified through meta-analysis, a powerful approach that enables the use of large sample sizes while protecting against common artifacts due to population structure and repeated small-sample analyses sharing individual-level data. As the focus of genetic association studies shifts to rare variants, genes and other functional units are becoming the focus of analysis. Here we propose and evaluate new approaches for performing meta-analysis of rare variant association tests, including burden tests, weighted burden tests, variable-threshold tests and tests that allow variants with opposite effects to be grouped together. We show that our approach retains useful features from single-variant meta-analysis approaches and demonstrate its use in a study of blood lipid levels in ∼18,500 individuals genotyped with exome arrays.

Peloso, Gina M (författare)
Zhan, Xiaowei (författare)
Holmen, Oddgeir L (författare)
Zawistowski, Matthew (författare)
Feng, Shuang (författare)
Nikpay, Majid (författare)
Auer, Paul L (författare)
Goel, Anuj (författare)
Zhang, He (författare)
Peters, Ulrike (författare)
Farrall, Martin (författare)
Orho-Melander, MarjuLund University,Lunds universitet,Diabetes - kardiovaskulär sjukdom,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Cardiovascular Disease,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-mor (författare)
Kooperberg, Charles (författare)
McPherson, Ruth (författare)
Watkins, Hugh (författare)
Willer, Cristen J (författare)
Hveem, Kristian (författare)
Melander, OlleLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-ome (författare)
Kathiresan, Sekar (författare)
Abecasis, Gonçalo R (författare)
Diabetes - kardiovaskulär sjukdomForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC46:2, s. 200-2001546-17181061-4036

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Kardiologi

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.