SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4869e8fd-0422-49b6-8631-d801de373cf9"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4869e8fd-0422-49b6-8631-d801de373cf9" > Molecular pathways ...

  • Sandling, Johanna K.Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi (författare)

Molecular pathways in patients with systemic lupus erythematosus revealed by gene-centred DNA sequencing

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-10-09
  • BMJ,2021
  • 9 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:4869e8fd-0422-49b6-8631-d801de373cf9
  • https://lup.lub.lu.se/record/4869e8fd-0422-49b6-8631-d801de373cf9URI
  • https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2020-218636DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-180252URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:145775611URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-173424URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-434591URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Funding Agencies|AstraZeneca-Science for Life Laboratory Research Collaboration grant (DISSECT); Swedish Research Council for Medicine and Health [2018-02399, 2018-02535]; Swedish Rheumatism Association; King Gustav Vs 80-year Foundation; Swedish-Heart-Lung foundationSwedish Heart-Lung Foundation; Wallenberg Scholar Award; Swedish Society of Medicine; Science for Life Laboratory; Swedish Research Council (VR-RFI)Swedish Research Council; Uppsala University; Knut and Alice Wallenberg FoundationKnut & Alice Wallenberg Foundation
  • Objectives: Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with extensive heterogeneity in disease presentation between patients, which is likely due to an underlying molecular diversity. Here, we aimed at elucidating the genetic aetiology of SLE from the immunity pathway level to the single variant level, and stratify patients with SLE into distinguishable molecular subgroups, which could inform treatment choices in SLE. Methods: We undertook a pathway-centred approach, using sequencing of immunological pathway genes. Altogether 1832 candidate genes were analysed in 958 Swedish patients with SLE and 1026 healthy individuals. Aggregate and single variant association testing was performed, and we generated pathway polygenic risk scores (PRS). Results: We identified two main independent pathways involved in SLE susceptibility: T lymphocyte differentiation and innate immunity, characterised by HLA and interferon, respectively. Pathway PRS defined pathways in individual patients, who on average were positive for seven pathways. We found that SLE organ damage was more pronounced in patients positive for the T or B cell receptor signalling pathways. Further, pathway PRS-based clustering allowed stratification of patients into four groups with different risk score profiles. Studying sets of genes with priors for involvement in SLE, we observed an aggregate common variant contribution to SLE at genes previously reported for monogenic SLE as well as at interferonopathy genes. Conclusions: Our results show that pathway risk scores have the potential to stratify patients with SLE beyond clinical manifestations into molecular subsets, which may have implications for clinical follow-up and therapy selection.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Pucholt, Pascal,Dr,1985-Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi(Swepub:uu)paspu920 (författare)
  • Hultin-Rosenberg, LinaUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)linhu641 (författare)
  • Farias, Fabiana H. G.Uppsala universitet,Uppsala University,Washington University in St. Louis,Uppsala Univ, Sweden; Washington Univ, MO 63110 USA,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Washington Univ, Dept Psychiat, St Louis, MO 63110 USA.(Swepub:uu)fabfa647 (författare)
  • Kozyrev, Sergey V.Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)sekoz957 (författare)
  • Eloranta, Maija-LeenaUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi(Swepub:uu)maelo020 (författare)
  • Bengtsson, Anders A.Uppsala universitet,Lund University,Lunds universitet,Uppsala University,University of Oslo,Odense University Hospital,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Uppsala Univ, Sweden,Lund Univ, Skane Univ Hosp, Dept Clin Sci Lund, Rheumatol, Lund, Sweden.,Reumatologi(Swepub:uu)andax639 (författare)
  • Bianchi, MatteoUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)matbi944 (författare)
  • Padyukov, LeonidKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Bengtsson, ChristineUmeå universitet,Umeå University,Reumatologi,Umeå Univ, Dept Publ Hlth & Clin Med Rheumatol, Umeå, Sweden.(Swepub:umu)chbe0055 (författare)
  • Jonsson, RolandUniversity of Bergen,Univ Bergen, Dept Clin Sci, Broegelmann Res Lab, Bergen, Norway. (författare)
  • Omdal, RoaldStavanger University Hospital,University of Bergen,Univ Bergen, Dept Clin Sci, Broegelmann Res Lab, Bergen, Norway.;Stavanger Univ Hosp, Dept Internal Med, Clin Immunol Unit, Stavanger, Norway. (författare)
  • Lie, Benedicte A.University of Oslo,Univ Oslo, Dept Med Genet, Oslo, Norway. (författare)
  • Massarenti, LauraCopenhagen University Hospital,Copenhagen Univ Hosp, Rigshosp, Ctr Rheumatol & Spine Dis, Inst Inflammat Res, Copenhagen, Denmark. (författare)
  • Steffensen, RudiAalborg University,Aalborg Univ, Dept Clin Immunol, Aalborg, Denmark. (författare)
  • Jakobsen, Marianne A.Odense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Clin Immunol, Odense, Denmark. (författare)
  • Lillevang, Søren T.Odense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Clin Immunol, Odense, Denmark. (författare)
  • Lerang, KarolineOslo university hospital,Oslo Univ Hosp, Dept Rheumatol, Oslo, Norway. (författare)
  • Molberg, ØyvindOslo university hospital,University of Oslo,Oslo Univ Hosp, Dept Rheumatol, Oslo, Norway.;Univ Oslo, Inst Clin Med, Oslo, Norway. (författare)
  • Voss, AnneOdense University Hospital,Odense Univ Hosp, Dept Rheumatol, Odense, Denmark. (författare)
  • Troldborg, AnneAarhus University Hospital,Aarhus University,Aarhus Univ Hosp, Dept Rheumatol, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ, Inst Clin Med, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Jacobsen, SørenCopenhagen University Hospital,University of Copenhagen,Copenhagen Univ Hosp, Rigshosp, Ctr Rheumatol & Spine Dis, Copenhagen, Denmark.;Univ Copenhagen, Inst Clin Med, Copenhagen, Denmark. (författare)
  • Syvänen, Ann-Christine,1950-Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)anncsyva (författare)
  • Jönsen, AndreasLund University,Lunds universitet,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Lund Univ, Skane Univ Hosp, Dept Clin Sci Lund, Rheumatol, Lund, Sweden.(Swepub:lu)reum-ajo (författare)
  • Gunnarsson, IvaKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Svenungsson, ElisabetKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Rantapää-Dahlqvist, SolbrittUmeå universitet,Umeå University,Reumatologi,Umeå Univ, Dept Publ Hlth & Clin Med Rheumatol, Umeå, Sweden.(Swepub:umu)sora0001 (författare)
  • Bengtsson, Anders A.Lund University,Lunds universitet,Lund SLE Research Group,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)reum-abe (författare)
  • Sjöwall, ChristopherLinköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Reumatologiska kliniken i Östergötland,Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci, Div Inflammat & Infect, Linköping, Sweden.(Swepub:liu)chrsj93 (författare)
  • Leonard, Dag,1975-Uppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi(Swepub:uu)dagle338 (författare)
  • Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Uppsala University,Broad Institute,Uppsala Univ, Sweden; Broad Inst MIT & Harvard, MA 02142 USA,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Inst MIT & Harvard, Cambridge, MA 02142 USA.(Swepub:uu)kerli865 (författare)
  • Rönnblom, LarsUppsala universitet,Uppsala University,Uppsala Univ, Sweden,Reumatologi(Swepub:uu)larsronn (författare)
  • Molberg, O (författare)
  • Dahlqvist, Johanna,1979-Uppsala universitet,Reumatologi,DISSECT consortium(Swepub:uu)johda205 (bidragsgivare)
  • Uppsala UniversityUppsala Univ, Sweden (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Annals of the Rheumatic Diseases: BMJ80:1, s. 109-1170003-49671468-2060

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy