Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:78b7cd41-aebe-4756-b732-c07ef1455952" > Landscape of somati...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Nik-Zainal, SerenaWellcome Trust Sanger Institute (författare)

Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences

Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016-05-02
Springer Science and Business Media LLC,2016
8 s.

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:78b7cd41-aebe-4756-b732-c07ef1455952
https://lup.lub.lu.se/record/78b7cd41-aebe-4756-b732-c07ef1455952URI
https://doi.org/10.1038/nature17676DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

We analysed whole-genome sequences of 560 breast cancers to advance understanding of the driver mutations conferring clonal advantage and the mutational processes generating somatic mutations. We found that 93 protein-coding cancer genes carried probable driver mutations. Some non-coding regions exhibited high mutation frequencies, but most have distinctive structural features probably causing elevated mutation rates and do not contain driver mutations. Mutational signature analysis was extended to genome rearrangements and revealed twelve base substitution and six rearrangement signatures. Three rearrangement signatures, characterized by tandem duplications or deletions, appear associated with defective homologous-recombination-based DNA repair: one with deficient BRCA1 function, another with deficient BRCA1 or BRCA2 function, the cause of the third is unknown. This analysis of all classes of somatic mutation across exons, introns and intergenic regions highlights the repertoire of cancer genes and mutational processes operating, and progresses towards a comprehensive account of the somatic genetic basis of breast cancer.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Cancer och onkologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Cancer and Oncology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Cell- och molekylärbiologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Cell and Molecular Biology hsv//eng
Breast Neoplasms
Cohort Studies
DNA Mutational Analysis
DNA Replication
DNA, Neoplasm
Female
Genes, BRCA1
Genes, BRCA2
Genome, Human
Genomics
Humans
Male
Mutagenesis
Mutation
Mutation Rate
Oncogenes
Recombinational DNA Repair

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-jst (författare)
Ramakrishna, ManasaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Glodzik, DominikWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Martincorena, InigoWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Alexandrov, Ludmil BWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Martin, SanchaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Wedge, David CWellcome Trust Sanger Institute (författare)
Van Loo, Peter (författare)
Ju, Young Seok (författare)
Smid, Marcel (författare)
Brinkman, Arie B (författare)
Morganella, Sandro (författare)
Aure, Miriam R (författare)
Lingjærde, Ole Christian (författare)
Langerød, Anita (författare)
Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)thep-mri (författare)
Ahn, Sung-Min (författare)
Boyault, Sandrine (författare)
Brock, Jane E (författare)
Broeks, Annegien (författare)
Butler, Adam (författare)
Desmedt, Christine (författare)
Dirix, Luc (författare)
Dronov, Serge (författare)
Fatima, Aquila (författare)
Foekens, John A (författare)
Gerstung, Moritz (författare)
Hooijer, Gerrit K J (författare)
Jang, Se Jin (författare)
Jones, David R (författare)
Kim, Hyung-Yong (författare)
King, Tari A (författare)
Krishnamurthy, Savitri (författare)
Lee, Hee Jin (författare)
Lee, Jeong-Yeon (författare)
Li, Yilong (författare)
McLaren, Stuart (författare)
Menzies, Andrew (författare)
Mustonen, Ville (författare)
O'Meara, Sarah (författare)
Pauporté, Iris (författare)
Pivot, Xavier (författare)
Purdie, Colin A (författare)
Raine, Keiran (författare)
Ramakrishnan, Kamna (författare)
Rodríguez-González, F Germán (författare)
Romieu, Gilles (författare)
Sieuwerts, Anieta M (författare)
Simpson, Peter T (författare)
Shepherd, Rebecca (författare)
Stebbings, Lucy (författare)
Stefansson, Olafur A (författare)
Teague, Jon (författare)
Tommasi, Stefania (författare)
Treilleux, Isabelle (författare)
Van den Eynden, Gert G (författare)
Vermeulen, Peter (författare)
Vincent-Salomon, Anne (författare)
Yates, Lucy (författare)
Caldas, Carlos (författare)
van't Veer, Laura (författare)
Tutt, Andrew (författare)
Knappskog, Stian (författare)
Tan, Benita Kiat Tee (författare)
Jonkers, Jos (författare)
Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups(Swepub:lu)onk-abo (författare)
Ueno, Naoto T (författare)
Sotiriou, Christos (författare)
Viari, Alain (författare)
Futreal, P Andrew (författare)
Campbell, Peter J (författare)
Span, Paul N (författare)
Van Laere, Steven (författare)
Lakhani, Sunil R (författare)
Eyfjord, Jorunn E (författare)
Thompson, Alastair M (författare)
Birney, Ewan (författare)
Stunnenberg, Hendrik G (författare)
van de Vijver, Marc J (författare)
Martens, John W M (författare)
Børresen-Dale, Anne-Lise (författare)
Richardson, Andrea L (författare)
Kong, Gu (författare)
Thomas, Gilles (författare)
Stratton, Michael R (författare)
Wellcome Trust Sanger InstituteBröstcancer-genetik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC534:7605, s. 47-540028-08361476-4687

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Nik-Zainal, Sere ...; Davies, Helen; Staaf, Johan; Ramakrishna, Man ...; Glodzik, Dominik; Zou, Xueqing; visa fler...; Martincorena, In ...; Alexandrov, Ludm ...; Martin, Sancha; Wedge, David C; Van Loo, Peter; Ju, Young Seok; Smid, Marcel; Brinkman, Arie B; Morganella, Sand ...; Aure, Miriam R; Lingjærde, Ole C ...; Langerød, Anita; Ringnér, Markus; Ahn, Sung-Min; Boyault, Sandrin ...; Brock, Jane E; Broeks, Annegien; Butler, Adam; Desmedt, Christi ...; Dirix, Luc; Dronov, Serge; Fatima, Aquila; Foekens, John A; Gerstung, Moritz; Hooijer, Gerrit ...; Jang, Se Jin; Jones, David R; Kim, Hyung-Yong; King, Tari A; Krishnamurthy, S ...; Lee, Hee Jin; Lee, Jeong-Yeon; Li, Yilong; McLaren, Stuart; Menzies, Andrew; Mustonen, Ville; O'Meara, Sarah; Pauporté, Iris; Pivot, Xavier; Purdie, Colin A; Raine, Keiran; Ramakrishnan, Ka ...; Rodríguez-Gonzál ...; Romieu, Gilles; Sieuwerts, Aniet ...; Simpson, Peter T; Shepherd, Rebecc ...; Stebbings, Lucy; Stefansson, Olaf ...; Teague, Jon; Tommasi, Stefani ...; Treilleux, Isabe ...; Van den Eynden, ...; Vermeulen, Peter; Vincent-Salomon, ...; Yates, Lucy; Caldas, Carlos; van't Veer, Laur ...; Tutt, Andrew; Knappskog, Stian; Tan, Benita Kiat ...; Jonkers, Jos; Borg, Åke; Ueno, Naoto T; Sotiriou, Christ ...; Viari, Alain; Futreal, P Andre ...; Campbell, Peter ...; Span, Paul N; Van Laere, Steve ...; Lakhani, Sunil R; Eyfjord, Jorunn ...; Thompson, Alasta ...; Birney, Ewan; Stunnenberg, Hen ...; van de Vijver, M ...; Martens, John W ...; Børresen-Dale, A ...; Richardson, Andr ...; Kong, Gu; Thomas, Gilles; Stratton, Michae ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

Artiklar i publikationen: Nature

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se