Lipid-Based Passivation in Nanofluidics

Persson, Fredrik,1979Uppsala universitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU),Beräknings- och systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab (författare)

Stretching DNA in nanochannels is a useful tool for direct, visual studies of genomic DNA at the single molecule level. To facilitate the study of the interaction of linear DNA with proteins in nanochannels, we have implemented a highly effective passivation scheme based on lipid bilayers. We demonstrate virtually complete long-term passivation of nanochannel surfaces to a range of relevant reagents, including streptavidin-coated quantum dots, RecA proteins, and RecA-DNA complexes. We show that the performance of the lipid bilayer is significantly better than that of standard bovine serum albumin-based passivation. Finally, we show how the passivated devices allow us to monitor single DNA cleavage events during enzymatic degradation by DNase I. We expect that our approach will open up for detailed, systematic studies of a wide range of protein-DNA interactions with high spatial and temporal resolution.

NATURVETENSKAP Kemi Fysikalisk kemi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Chemical Sciences Physical Chemistry hsv//eng
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Nanoteknik Nanoteknik hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Nano-technology Nano-technology hsv//eng
NATURVETENSKAP Fysik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Physical Sciences hsv//eng
lipid bilayer
Nanofluidics
antifouling
single molecules
passivation
protein−DNA interactions
Nanofluidics
passivation
antifouling
lipid bilayer
protein-DNA
interactions
single molecules
Nanofluidics; passivation; antifouling; lipid bilayer; protein−DNA interactions; single molecules

Fritzsche, Joachim,1977Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)(Swepub:cth)joafri (författare)
Mir, K. U.Wellcome Trust Centre for Human Genetics (författare)
Modesti, M.Centre de Recherche en Cancerologie de Marseille (författare)
Westerlund, Fredrik,1978Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)fredrikw (författare)
Tegenfeldt, JonasGothenburg University,Göteborgs universitet,Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)(Swepub:gu)xjonte (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för fysik (GU) (creator_code:org_t)

Ingår i:Nano Letters: American Chemical Society (ACS)12:5, s. 2260-22651530-69921530-6984

Av författaren/redakt...: Persson, Fredrik ...; Fritzsche, Joach ...; Mir, K. U.; Modesti, M.; Westerlund, Fred ...; Tegenfeldt, Jona ...

Om ämnet

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Nanoteknik; och Nanoteknik

Av lärosätet: Chalmers tekniska högskola; Lunds universitet; Göteborgs universitet; Uppsala universitet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.