GROMACS: High performance molecular simulations through multi-level parallelism from laptops to supercomputers

Tyck till om SwePub Sök här!

Abraham, Mark James, 1977- (författare): KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik

Murtola, Teemu (författare)

Schulz, Roland (författare)

Pall, Szilard (författare): KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik

Smith, Jeremy C. (författare)

Hess, Berk (författare): KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik

Lindahl, Erik, 1972- (författare): KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Teoretisk biologisk fysik

(creator_code:org_t)

Relaterad länk:: https://doi.org/10.1...; visa fler...; http://www.sciencedi...; https://kth.diva-por... (primary) (Raw object); https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Abstract Ämnesord

Stäng

GROMACS is one of the most widely used open-source and free software codes in chemistry, used primarily for dynamical simulations of biomolecules. It provides a rich set of calculation types, preparation and analysis tools. Several advanced techniques for free-energy calculations are supported. In version 5, it reaches new performance heights, through several new and enhanced parallelization algorithms. These work on every level; SIMD registers inside cores, multithreading, heterogeneous CPU–GPU acceleration, state-of-the-art 3D domain decomposition, and ensemble-level parallelization through built-in replica exchange and the separate Copernicus framework. The latest best-in-class compressed trajectory storage format is supported.

Av författaren/redakt...: Abraham, Mark Ja ...; Murtola, Teemu; Schulz, Roland; Pall, Szilard; Smith, Jeremy C.; Hess, Berk; visa fler...; Lindahl, Erik, 1 ...; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.