Motifs of Three HLA-DQ Amino Acid Residues (alpha 44, beta 57, beta 135) Capture Full Association With the Risk of Type 1 Diabetes in DQ2 and DQ8 Children

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-167651" > Motifs of Three HLA...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Motifs of Three HLA-DQ Amino Acid Residues (alpha 44, beta 57, beta 135) Capture Full Association With the Risk of Type 1 Diabetes in DQ2 and DQ8 Children

Zhao, Lue Ping (författare): Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA

Papadopoulos, George K. (författare): Technol Educ Inst Epirus, Greece

Kwok, William W. (författare): Benaroya Res Inst Virginia Mason, WA USA

visa fler...

Moustakas, Antonis K. (författare): Ionian Univ, Greece

Bondinas, George P. (författare): Technol Educ Inst Epirus, Greece

Larsson, Helena Elding (författare): Lund Univ CRC, Sweden

Ludvigsson, Johnny (författare): Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus

Marcus, Claude (författare): Karolinska Inst, Sweden

Samuelsson, Ulf, 1951- (författare): Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus

Wang, Ruihan (författare): Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA

Pyo, Chul-Woo (författare): Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA

Nelson, Wyatt C. (författare): Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA

Geraghty, Daniel E. (författare): Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA

Lernmark, Ake (författare): Lund Univ CRC, Sweden

visa färre...

(creator_code:org_t)

2020-04-03
2020
Engelska.
Ingår i: Diabetes. - : AMER DIABETES ASSOC. - 0012-1797 .- 1939-327X. ; 69:7, s. 1573-1587

Relaterad länk:: https://diabetes.dia...; visa fler...; https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.2...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

HLA-DQA1 and -DQB1 are strongly associated with type 1 diabetes (T1D), and DQ8.1 and DQ2.5 are major risk haplotypes. Next-generation targeted sequencing of HLA-DQA1 and -DQB1 in Swedish newly diagnosed 1- to 18 year-old patients (n= 962) and control subjects (n= 636) was used to construct abbreviated DQ haplotypes, converted into amino acid (AA) residues, and assessed for their associations with T1D. A hierarchically organized haplotype (HOH) association analysis allowed 45 unique DQ haplotypes to be categorized into seven clusters. The DQ8/9 cluster included two DQ8.1 risk and the DQ9 resistant haplotypes, and the DQ2 cluster included the DQ2.5 risk and DQ2.2 resistant haplotypes. Within each cluster, HOH found residues alpha 44Q (odds ratio [OR] 3.29,P= 2.38 * 10(-85)) and beta 57A (OR 3.44,P= 3.80 * 10(-84)) to be associated with T1D in the DQ8/9 cluster representing all ten residues (alpha 22, alpha 23, alpha 44, alpha 49, alpha 51, alpha 53, alpha 54, alpha 73, alpha 184, beta 57) due to complete linkage disequilibrium (LD) of alpha 44 with eight such residues. Within the DQ2 cluster and due to LD, HOH analysis found alpha 44C and beta 135D to share the risk for T1D (OR 2.10,P= 1.96 * 10(-20)). The motif "QAD" of alpha 44, beta 57, and beta 135 captured the T1D risk association of DQ8.1 (OR 3.44,P= 3.80 * 10(-84)), and the corresponding motif "CAD" captured the risk association of DQ2.5 (OR 2.10,P= 1.96 * 10(-20)). Two risk associations were related to GAD65 autoantibody (GADA) and IA-2 autoantibody (IA-2A) but in opposite directions. CAD was positively associated with GADA (OR 1.56,P= 6.35 * 10(-8)) but negatively with IA-2A (OR 0.59,P= 6.55 * 10(-11)). QAD was negatively associated with GADA (OR 0.88;P= 3.70 * 10(-3)) but positively with IA-2A (OR 1.64;P= 2.40 * 10(-14)), despite a single difference at alpha 44. The residues are found in and around anchor pockets 1 and 9, as potential T-cell receptor contacts, in the areas for CD4 binding and putative homodimer formation. The identification of three HLA-DQ AAs (alpha 44, beta 57, beta 135) conferring T1D risk should sharpen functional and translational studies.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Diabetes (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Zhao, Lue Ping; Papadopoulos, Ge ...; Kwok, William W.; Moustakas, Anton ...; Bondinas, George ...; Larsson, Helena ...; visa fler...; Ludvigsson, John ...; Marcus, Claude; Samuelsson, Ulf, ...; Wang, Ruihan; Pyo, Chul-Woo; Nelson, Wyatt C.; Geraghty, Daniel ...; Lernmark, Ake; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

Artiklar i publikationen: Diabetes

Av lärosätet: Linköpings universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se