Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-259595" >
Genome-Wide Analyse...
Genome-Wide Analyses Suggest Mechanisms Involving Early B-cell Development in Canine IgA Deficiency
-
- Olsson, Mia (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Tengvall, Katarina, 1980- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Uppsala University
-
Frankowiack, Marcel (författare)
-
visa fler...
-
- Kierczak, Marcin (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Bergvall, Kerstin (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences
-
- Axelsson, Erik (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
Tintle, Linda (författare)
-
Marti, Eliane (författare)
-
Roosje, Petra (författare)
-
Leeb, Tosso (författare)
-
- Hedhammar, Åke (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences
-
- Hammarström, Lennart (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Lindblad-Toh, Kerstin (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2015-07-30
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 10:7
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
http://journals.plos...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://journals.plo...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://res.slu.se/i...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Immunoglobulin A deficiency (IgAD) is the most common primary immune deficiency disorder in both humans and dogs, characterized by recurrent mucosal tract infections and a predisposition for allergic and other immune mediated diseases. In several dog breeds, low IgA levels have been observed at a high frequency and with a clinical resemblance to human IgAD. In this study, we used genome-wide association studies (GWAS) to identify genomic regions associated with low IgA levels in dogs as a comparative model for human IgAD. We used a novel percentile groups-approach to establish breed-specific cut-offs and to perform analyses in a close to continuous manner. GWAS performed in four breeds prone to low IgA levels (German shepherd, Golden retriever, Labrador retriever and Shar-Pei) identified 35 genomic loci suggestively associated (p <0.0005) to IgA levels. In German shepherd, three genomic regions (candidate genes include KIRREL3 and SERPINA9) were genome-wide significantly associated (p <0.0002) with IgA levels. A ~20kb long haplotype on CFA28, significantly associated (p = 0.0005) to IgA levels in Shar-Pei, was positioned within the first intron of the gene SLIT1. Both KIRREL3 and SLIT1 are highly expressed in the central nervous system and in bone marrow and are potentially important during B-cell development. SERPINA9 expression is restricted to B-cells and peaks at the time-point when B-cells proliferate into antibody-producing plasma cells. The suggestively associated regions were enriched for genes in Gene Ontology gene sets involving inflammation and early immune cell development.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Veterinärmedicin -- Annan veterinärmedicin (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Veterinary Science -- Other Veterinary Science (hsv//eng)
Nyckelord
- Genome-wide association studies
- Dogs
- IgA
- immunodeficieny
- B-cell
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Olsson, Mia
-
Tengvall, Katari ...
-
Frankowiack, Mar ...
-
Kierczak, Marcin
-
Bergvall, Kersti ...
-
Axelsson, Erik
-
visa fler...
-
Tintle, Linda
-
Marti, Eliane
-
Roosje, Petra
-
Leeb, Tosso
-
Hedhammar, Åke
-
Hammarström, Len ...
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Immunologi inom ...
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Veterinärmedicin
-
och Annan veterinärm ...
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet