Probing the Virtual Proteome to Identify Novel Disease Biomarkers

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:72cac14a-bfb1-4c22-b4a0-a3edd2c9d336" > Probing the Virtual...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Probing the Virtual Proteome to Identify Novel Disease Biomarkers

Mosley, Jonathan D. (författare): Vanderbilt University

Benson, Mark D. (författare): Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School,Beth Israel Deaconess Medical Center

Smith, J. Gustav (författare): Lund University,Lunds universitet,Molecular Epidemiology and Cardiology,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

visa fler...

Melander, Olle (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Ngo, Debby (författare): Massachusetts General Hospital,Harvard University

Shaffer, Christian M. (författare): Vanderbilt University

Ferguson, Jane F. (författare): Vanderbilt University

Herzig, Matthew S. (författare): Beth Israel Deaconess Medical Center

McCarty, Catherine A. (författare): University of Minnesota

Chute, Christopher G. (författare): Johns Hopkins University

Jarvik, Gail P. (författare): University of Washington

Gordon, Adam S. (författare): University of Washington

Palmer, Melody R. (författare): University of Washington

Crosslin, David R. (författare): University of Washington

Larson, Eric B. (författare): Kaiser Permanente Research Institute,University of Washington

Carrell, David S. (författare): Kaiser Permanente Research Institute

Kullo, Iftikhar J. (författare): Mayo Clinic Minnesota

Pacheco, Jennifer A. (författare): Northwestern University

Peissig, Peggy L. (författare): Marshfield Clinic

Brilliant, Murray H. (författare): Marshfield Clinic

Kitchner, Terrie E. (författare): Marshfield Clinic

Linneman, James G. (författare): Marshfield Clinic

Namjou, Bahram (författare): University of Cincinnati,Cincinnati Children's Hospital Medical Center

Williams, Marc S. (författare): Geisinger Health System

Ritchie, Marylyn D. (författare): University of Pennsylvania

Borthwick, Kenneth M. (författare): Geisinger Health System

Kiryluk, Krzysztof (författare): Columbia University

Mentch, Frank D. (författare): The Children's Hospital of Philadelphia

Sleiman, Patrick M. (författare): The Children's Hospital of Philadelphia

Karlson, Elizabeth W. (författare): Harvard University,Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School

Verma, Shefali S. (författare): University of Pennsylvania

Zhu, Yineng (författare): Boston University

Vasan, Ramachandran S. (författare): Boston University

Yang, Qiong (författare): Boston University

Denny, Josh C. (författare): Vanderbilt University

Roden, Dan M. (författare): Vanderbilt University

Gerszten, Robert E. (författare): Beth Israel Deaconess Medical Center

Wang, Thomas J. (författare): Vanderbilt University

visa färre...

(creator_code:org_t)

2018
2018
Engelska 13 s.
Ingår i: Circulation. - 1524-4539. ; 138:22, s. 2469-2481

Relaterad länk:: http://dx.doi.org/10...; visa fler...; https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

BACKGROUND: Proteomic approaches allow measurement of thousands of proteins in a single specimen, which can accelerate biomarker discovery. However, applying these technologies to massive biobanks is not currently feasible because of the practical barriers and costs of implementing such assays at scale. To overcome these challenges, we used a "virtual proteomic" approach, linking genetically predicted protein levels to clinical diagnoses in >40 000 individuals. METHODS: We used genome-wide association data from the Framingham Heart Study (n=759) to construct genetic predictors for 1129 plasma protein levels. We validated the genetic predictors for 268 proteins and used them to compute predicted protein levels in 41 288 genotyped individuals in the Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE) cohort. We tested associations for each predicted protein with 1128 clinical phenotypes. Lead associations were validated with directly measured protein levels and either low-density lipoprotein cholesterol or subclinical atherosclerosis in the MDCS (Malmö Diet and Cancer Study; n=651). RESULTS: In the virtual proteomic analysis in eMERGE, 55 proteins were associated with 89 distinct diagnoses at a false discovery rate q<0.1. Among these, 13 associations involved lipid (n=7) or atherosclerosis (n=6) phenotypes. We tested each association for validation in MDCS using directly measured protein levels. At Bonferroni-adjusted significance thresholds, levels of apolipoprotein E isoforms were associated with hyperlipidemia, and circulating C-type lectin domain family 1 member B and platelet-derived growth factor receptor-β predicted subclinical atherosclerosis. Odds ratios for carotid atherosclerosis were 1.31 (95% CI, 1.08-1.58; P=0.006) per 1-SD increment in C-type lectin domain family 1 member B and 0.79 (0.66-0.94; P=0.008) per 1-SD increment in platelet-derived growth factor receptor-β. CONCLUSIONS: We demonstrate a biomarker discovery paradigm to identify candidate biomarkers of cardiovascular and other diseases.

Hitta via bibliotek

Circulation (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Mosley, Jonathan ...; Benson, Mark D.; Smith, J. Gustav; Melander, Olle; Ngo, Debby; Shaffer, Christi ...; visa fler...; Ferguson, Jane F ...; Herzig, Matthew ...; McCarty, Catheri ...; Chute, Christoph ...; Jarvik, Gail P.; Gordon, Adam S.; Palmer, Melody R ...; Crosslin, David ...; Larson, Eric B.; Carrell, David S ...; Kullo, Iftikhar ...; Pacheco, Jennife ...; Peissig, Peggy L ...; Brilliant, Murra ...; Kitchner, Terrie ...; Linneman, James ...; Namjou, Bahram; Williams, Marc S ...; Ritchie, Marylyn ...; Borthwick, Kenne ...; Kiryluk, Krzyszt ...; Mentch, Frank D.; Sleiman, Patrick ...; Karlson, Elizabe ...; Verma, Shefali S ...; Zhu, Yineng; Vasan, Ramachand ...; Yang, Qiong; Denny, Josh C.; Roden, Dan M.; Gerszten, Robert ...; Wang, Thomas J.; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Kardiologi

Artiklar i publikationen: Circulation

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Probing the Virtual Proteome to Identify Novel Disease Biomarkers

Ämnesord

Nyckelord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub