SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-129093"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-129093" > Geographical struct...

  • McEvoy, Brian P. (författare)

Geographical structure and differential natural selection among North European populations

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2009-03-05
  • Cold Spring Harbor Laboratory,2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-129093
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-129093URI
  • https://doi.org/10.1101/gr.083394.108DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:118682221URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Population structure can provide novel insight into the human past, and recognizing and correcting for such stratification is a practical concern in gene mapping by many association methodologies. We investigate these patterns, primarily through principal component (PC) analysis of whole genome SNP polymorphism, in 2099 individuals from populations of Northern European origin (Ireland, United Kingdom, Netherlands, Denmark, Sweden, Finland, Australia, and HapMap European-American). The major trends (PC1 and PC2) demonstrate an ability to detect geographic substructure, even over a small area like the British Isles, and this information can then be applied to finely dissect the ancestry of the European-Australian and European-American samples. They simultaneously point to the importance of considering population stratification in what might be considered a small homogeneous region. There is evidence from FST-based analysis of genic and nongenic SNPs that differential positive selection has operated across these populations despite their short divergence time and relatively similar geographic and environmental range. The pressure appears to have been focused on genes involved in immunity, perhaps reflecting response to infectious disease epidemic. Such an event may explain a striking selective sweep centered on the rs2508049-G allele, close to the HLA-G gene on chromosome 6. Evidence of the sweep extends over a 8-Mb/3.5-cM region. Overall, the results illustrate the power of dense genotype and sample data to explore regional population variation, the events that have crafted it, and their implications in both explaining disease prevalence and mapping these genes by association.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Montgomery, W (författare)
  • McRae, F (författare)
  • Ripatti, Samuli (författare)
  • Perola, Markus (författare)
  • Spector, D (författare)
  • Cherkas, Lynn (författare)
  • Ahmadi, R (författare)
  • Boomsma, Dorret (författare)
  • Willemsen, Gonneke (författare)
  • Hottenga, J (författare)
  • Pedersen, LKarolinska Institutet (författare)
  • Magnusson, EKarolinska Institutet (författare)
  • Kyvik, Ohm (författare)
  • Christensen, Kaare (författare)
  • Kaprio, Jaakko (författare)
  • Heikkila, Kauko (författare)
  • Palotie, Aarno (författare)
  • Widen, Elisabeth (författare)
  • Muilu, Juha (författare)
  • Syvänen, Ann-ChristineUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)anncsyva (författare)
  • Liljedahl, UlrikaUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)ullil257 (författare)
  • Hardiman, Orla (författare)
  • Cronin, Simon (författare)
  • Peltonen, Leena (författare)
  • Martin, G (författare)
  • Visscher, Peter M. (författare)
  • Karolinska InstitutetMolekylär medicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Research: Cold Spring Harbor Laboratory19:5, s. 804-8141088-90511549-5469

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy