Subtype-specific genomic alterations define new targets for soft-tissue sarcoma therapy.

Tyck till om SwePub Sök här!

Soft-tissue sarcomas, which result in approximately 10,700 diagnoses and 3,800 deaths per year in the United States, show remarkable histologic diversity, with more than 50 recognized subtypes. However, knowledge of their genomic alterations is limited. We describe an integrative analysis of DNA sequence, copy number and mRNA expression in 207 samples encompassing seven major subtypes. Frequently mutated genes included TP53 (17% of pleomorphic liposarcomas), NF1 (10.5% of myxofibrosarcomas and 8% of pleomorphic liposarcomas) and PIK3CA (18% of myxoid/round-cell liposarcomas, or MRCs). PIK3CA mutations in MRCs were associated with Akt activation and poor clinical outcomes. In myxofibrosarcomas and pleomorphic liposarcomas, we found both point mutations and genomic deletions affecting the tumor suppressor NF1. Finally, we found that short hairpin RNA (shRNA)-based knockdown of several genes amplified in dedifferentiated liposarcoma, including CDK4 and YEATS4, decreased cell proliferation. Our study yields a detailed map of molecular alterations across diverse sarcoma subtypes and suggests potential subtype-specific targets for therapy.

Taylor, Barry S (författare)
Banerji, Shantanu (författare)
Ramos, Alexis H (författare)
Lagos-Quintana, Mariana (författare)
Decarolis, Penelope L (författare)
Shah, Kinjal (författare)
Socci, Nicholas D (författare)
Weir, Barbara A (författare)
Ho, Alan (författare)
Chiang, Derek Y (författare)
Reva, Boris (författare)
Mermel, Craig H (författare)
Getz, Gad (författare)
Antipin, Yevgenyi (författare)
Beroukhim, Rameen (författare)
Major, John E (författare)
Hatton, Charles (författare)
Nicoletti, Richard (författare)
Hanna, Megan (författare)
Sharpe, Ted (författare)
Fennell, Tim J (författare)
Cibulskis, Kristian (författare)
Onofrio, Robert C (författare)
Saito, Tsuyoshi (författare)
Shukla, Neerav (författare)
Lau, Christopher (författare)
Nelander, Sven,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin,Institute of Medicine(Swepub:gu)xnelsv (författare)
Silver, Serena J (författare)
Sougnez, Carrie (författare)
Viale, Agnes (författare)
Winckler, Wendy (författare)
Maki, Robert G (författare)
Garraway, Levi A (författare)
Lash, Alex (författare)
Greulich, Heidi (författare)
Root, David E (författare)
Sellers, William R (författare)
Schwartz, Gary K (författare)
Antonescu, Cristina R (författare)
Lander, Eric S (författare)
Varmus, Harold E (författare)
Ladanyi, Marc (författare)
Sander, Chris (författare)
Meyerson, Matthew (författare)
Singer, Samuel (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för medicin (creator_code:org_t)

Ingår i:Nature genetics: Springer Science and Business Media LLC42:8, s. 715-211546-17181061-4036

Av författaren/redakt...: Barretina, Jordi; Taylor, Barry S; Banerji, Shantan ...; Ramos, Alexis H; Lagos-Quintana, ...; Decarolis, Penel ...; visa fler...; Shah, Kinjal; Socci, Nicholas ...; Weir, Barbara A; Ho, Alan; Chiang, Derek Y; Reva, Boris; Mermel, Craig H; Getz, Gad; Antipin, Yevgeny ...; Beroukhim, Ramee ...; Major, John E; Hatton, Charles; Nicoletti, Richa ...; Hanna, Megan; Sharpe, Ted; Fennell, Tim J; Cibulskis, Krist ...; Onofrio, Robert ...; Saito, Tsuyoshi; Shukla, Neerav; Lau, Christopher; Nelander, Sven, ...; Silver, Serena J; Sougnez, Carrie; Viale, Agnes; Winckler, Wendy; Maki, Robert G; Garraway, Levi A; Lash, Alex; Greulich, Heidi; Root, David E; Sellers, William ...; Schwartz, Gary K; Antonescu, Crist ...; Lander, Eric S; Varmus, Harold E; Ladanyi, Marc; Sander, Chris; Meyerson, Matthe ...; Singer, Samuel; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.