Sökning: L773:0022 2836 OR L773:1089 8638 >
In silico predictio...
In silico prediction of the peroxisomal proteome in fungi, plants and animals.
-
- Emanuelsson, Olof (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- Elofsson, Arne (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
- von Heijne, Gunnar (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
-
visa fler...
-
- Cristóbal, Susana (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi,Molekylär cellbiologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2003
- 2003
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Molecular Biology. - 0022-2836 .- 1089-8638. ; 330:2, s. 443-456
- Relaterad länk:
-
http://www.ncbi.nlm....
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In an attempt to improve our abilities to predict peroxisomal proteins, we have combined machine-learning techniques for analyzing peroxisomal targeting signals (PTS1) with domain-based cross-species comparisons between eight eukaryotic genomes. Our results indicate that this combined approach has a significantly higher specificity than earlier attempts to predict peroxisomal localization, without a loss in sensitivity. This allowed us to predict 430 peroxisomal proteins that almost completely lack a localization annotation. These proteins can be grouped into 29 families covering most of the known steps in all known peroxisomal pathways. In general, plants have the highest number of predicted peroxisomal proteins, and fungi the smallest number.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- ACYL-COA OXIDASE
- TARGETING SIGNAL
- BETA-OXIDATION
- SACCHAROMYCES-CEREVISIAE
- ISOPRENOID BIOSYNTHESIS
- PHYLOGENETIC PROFILES
- SUBCELLULAR LOCATION
- MEMBRANE-PROTEINS
- PSI-BLAST
- IMPORT
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas