SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:142915634"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:142915634" > Disruption of chrom...

Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer

Akdemir, KC (författare)
University of Texas MD Anderson Cancer Center
Le, VTT (författare)
Salk Institute for Biological Studies
Chandran, S (författare)
Salk Institute for Biological Studies
visa fler...
Li, YL (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Verhaak, RG (författare)
QIMR Berghofer Medical Research Institute
Beroukhim, R (författare)
Dana-Farber Cancer Institute
Campbell, PJ (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Chin, L (författare)
University of Texas
Dixon, JR (författare)
Salk Institute for Biological Studies
Futreal, PA (författare)
University of Texas MD Anderson Cancer Center
Alvarez, EG (författare)
Baez-Ortega, A (författare)
Beroukhim, R (författare)
Boutros, PC (författare)
Bowtell, DDL (författare)
Brors, B (författare)
Burns, KH (författare)
Chan, K (författare)
Chen, K (författare)
Cortes-Ciriano, I (författare)
Dueso-Barroso, A (författare)
Dunford, AJ (författare)
Edwards, PA (författare)
Estivill, X (författare)
Etemadmoghadam, D (författare)
Feuerbach, L (författare)
Fink, JL (författare)
Frenkel-Morgenstern, M (författare)
Garsed, DW (författare)
Gerstein, M (författare)
Gordenin, DA (författare)
Haan, D (författare)
Haber, JE (författare)
Hess, JM (författare)
Hutter, B (författare)
Imielinski, M (författare)
Jones, DTW (författare)
Ju, YS (författare)
Kazanov, MD (författare)
Klimczak, LJ (författare)
Koh, Y (författare)
Korbel, JO (författare)
Kumar, K (författare)
Lee, EA (författare)
Lee, JJK (författare)
Lynch, AG (författare)
Macintyre, G (författare)
Markowetz, F (författare)
Martincorena, I (författare)
Martinez-Fundichely, A (författare)
Meyerson, M (författare)
Miyano, S (författare)
Nakagawa, H (författare)
Navarro, FCP (författare)
Ossowski, S (författare)
Park, PJ (författare)
Pearson, JV (författare)
Puiggros, M (författare)
Rippe, K (författare)
Roberts, ND (författare)
Roberts, SA (författare)
Rodriguez-Martin, B (författare)
Schumacher, SE (författare)
Scully, R (författare)
Shackleton, M (författare)
Sidiropoulos, N (författare)
Sieverling, L (författare)
Stewart, C (författare)
Torrents, D (författare)
Tubio, JMC (författare)
Villasante, I (författare)
Waddell, N (författare)
Wala, JA (författare)
Weischenfeldt, J (författare)
Yang, LX (författare)
Yao, XT (författare)
Yoon, SS (författare)
Zamora, J (författare)
Zhang, CZ (författare)
Borg, Åke (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
Ringnér, Markus (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
Staaf, Johan (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2020-02-05
2020
Engelska.
Ingår i: Nature genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1546-1718 .- 1061-4036. ; 52:3, s. 294-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Chromatin is folded into successive layers to organize linear DNA. Genes within the same topologically associating domains (TADs) demonstrate similar expression and histone-modification profiles, and boundaries separating different domains have important roles in reinforcing the stability of these features. Indeed, domain disruptions in human cancers can lead to misregulation of gene expression. However, the frequency of domain disruptions in human cancers remains unclear. Here, as part of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium of the International Cancer Genome Consortium (ICGC) and The Cancer Genome Atlas (TCGA), which aggregated whole-genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumor types, we analyzed 288,457 somatic structural variations (SVs) to understand the distributions and effects of SVs across TADs. Notably, SVs can lead to the fusion of discrete TADs, and complex rearrangements markedly change chromatin folding maps in the cancer genomes. Notably, only 14% of the boundary deletions resulted in a change in expression in nearby genes of more than twofold.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Nyckelord

Chromatin/genetics
Gene Expression Regulation, Neoplastic
Gene Rearrangement/genetics
Genome, Human/genetics
Genomic Structural Variation
Humans
Neoplasms/genetics

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy