SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-227720"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-227720" > High-Quality Genome...

High-Quality Genome Assemblies of 4 Members of the Podospora anserina Species Complex

Ament-Velásquez, Sandra Lorena, Ph.D. 1988- (författare)
Stockholms universitet,Avdelningen för populationsgenetik,Stockholm Univ, Dept Zool, Div Populat Genet, S-10691 Stockholm, Sweden.
Vogan, Aaron A. (författare)
Uppsala universitet,Systematisk biologi
Wallerman, Ola (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
visa fler...
Hartmann, Fanny E. (författare)
Univ Paris Saclay, Ecol Systemat Evolut, CNRS, AgroParisTech, F-91198 Gif Sur Yvette, France.
Gautier, Valerie (författare)
Univ Paris Cite, Lab Interdisciplinaire Energies Demain LIED, F-75013 Paris, France.
Silar, Philippe (författare)
Univ Paris Cite, Lab Interdisciplinaire Energies Demain LIED, F-75013 Paris, France.
Giraud, Tatiana (författare)
Univ Paris Saclay, Ecol Systemat Evolut, CNRS, AgroParisTech, F-91198 Gif Sur Yvette, France.
Johannesson, Hanna, 1970- (författare)
Uppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik,Systematisk biologi,Royal Swedish Acad Sci, S-11418 Stockholm, Sweden.;Stockholm Univ, Dept Ecol Environm & Plant Sci, S-10691 Stockholm, Sweden.
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Oxford University Press, 2024
2024
Engelska.
Ingår i: Genome Biology and Evolution. - : Oxford University Press. - 1759-6653. ; 16:3
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The filamentous fungus Podospora anserina is a model organism used extensively in the study of molecular biology, senescence, prion biology, meiotic drive, mating-type chromosome evolution, and plant biomass degradation. It has recently been established that P. anserina is a member of a complex of 7 closely related species. In addition to P. anserina, high-quality genomic resources are available for 2 of these taxa. Here, we provide chromosome-level annotated assemblies of the 4 remaining species of the complex, as well as a comprehensive data set of annotated assemblies from a total of 28 Podospora genomes. We find that all 7 species have genomes of around 35 Mb arranged in 7 chromosomes that are mostly collinear and less than 2% divergent from each other at genic regions. We further attempt to resolve their phylogenetic relationships, finding significant levels of phylogenetic conflict as expected from a rapid and recent diversification.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)

Nyckelord

Sordariales
Podospora bellae-mahoneyi
Podospora pseudoanserina
Podospora pseudopauciseta
Podospora pseudocomata
chromosomal rearrangements
phylogenomics

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy