SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4e293ab2-6cbb-44a8-ba36-2e6258491a84"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4e293ab2-6cbb-44a8-ba36-2e6258491a84" > The circular RNome ...

The circular RNome of primary breast cancer

Smid, Marcel (författare)
Erasmus University Medical Center
Wilting, Saskia M. (författare)
Erasmus University Medical Center
Uhr, Katharina (författare)
Erasmus University Medical Center
visa fler...
Rodríguez-González, F. Germán (författare)
Erasmus University Medical Center
De Weerd, Vanja (författare)
Erasmus University Medical Center
Prager-Van Der Smissen, Wendy J.C. (författare)
Erasmus University Medical Center
Van Der Vlugt-Daane, Michelle (författare)
Erasmus University Medical Center
Van Galen, Anne (författare)
Erasmus University Medical Center
Nik-Zainal, Serena (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute,Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust
Butler, Adam (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Martin, Sancha (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Davies, Helen R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
Van De Vijver, Marc J. (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
Richardson, Andrea L. (författare)
Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School,Dana-Farber Cancer Institute
MacGrogan, Gaëten (författare)
Institut Bergoníe
Salgado, Roberto (författare)
University of Antwerp,Institut Jules Bordet
Van Den Eynden, Gert G.G.M. (författare)
University of Antwerp,Institut Jules Bordet
Purdie, Colin A. (författare)
Ninewells Hospital and Medical School
Thompson, Alastair M. (författare)
Ninewells Hospital and Medical School
Caldas, Carlos (författare)
University of Cambridge
Span, Paul N. (författare)
Radboud University Nijmegen
Sweep, Fred C.G.J. (författare)
Radboud University Nijmegen
Simpson, Peter T. (författare)
University of Queensland
Lakhani, Sunil R. (författare)
University of Queensland,Royal Brisbane and Women's Hospital
Van Laere, Steven (författare)
University of Antwerp
Desmedt, Christine (författare)
Institut Jules Bordet
Paradiso, Angelo (författare)
Istituto Tumori 'Giovanni Paolo II'
Eyfjord, Jorunn (författare)
University of Iceland
Broeks, Annegien (författare)
Netherlands Cancer Institute
Vincent-Salomon, Anne (författare)
Curie Institute, Paris
Futreal, Andrew P. (författare)
University of Texas
Knappskog, Stian (författare)
University of Bergen,Haukeland University Hospital
King, Tari (författare)
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Viari, Alain (författare)
National Institute for Research in Computer Science and Control (INIRA),Centre Léon Bérard
Børresen-Dale, Anne Lise (författare)
Oslo university hospital,University of Oslo
Stunnenberg, Hendrik G. (författare)
Radboud University Nijmegen
Stratton, Mike (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Foekens, John A. (författare)
Erasmus University Medical Center
Sieuwerts, Anieta M. (författare)
Erasmus University Medical Center
Martens, John W.M. (författare)
Erasmus University Medical Center
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2019-01-28
2019
Engelska 11 s.
Ingår i: Genome Research. - : Cold Spring Harbor Laboratory. - 1088-9051 .- 1549-5469. ; 29:3, s. 356-366
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10...
visa fler...
http://genome.cshlp....
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Circular RNAs (circRNAs) are a class of RNAs that is under increasing scrutiny, although their functional roles are debated. We analyzed RNA-seq data of 348 primary breast cancers and developed a method to identify circRNAs that does not rely on unmapped reads or known splice junctions. We identified 95,843 circRNAs, of which 20,441 were found recurrently. Of the circRNAs that match exon boundaries of the same gene, 668 showed a poor or even negative (R <0.2) correlation with the expression level of the linear gene. In silico analysis showed only a minority (8.5%) of circRNAs could be explained by known splicing events. Both these observations suggest that specific regulatory processes for circRNAs exist. We confirmed the presence of circRNAs of CNOT2, CREBBP, and RERE in an independent pool of primary breast cancers. We identified circRNA profiles associated with subgroups of breast cancers and with biological and clinical features, such as amount of tumor lymphocytic infiltrate and proliferation index. siRNA-mediated knockdown of circCNOT2 was shown to significantly reduce viability of the breast cancer cell lines MCF-7 and BT-474, further underlining the biological relevance of circRNAs. Furthermore, we found that circular, and not linear, CNOT2 levels are predictive for progression-free survival time to aromatase inhibitor (AI) therapy in advanced breast cancer patients, and found that circCNOT2 is detectable in cell-free RNA from plasma. We showed that circRNAs are abundantly present, show characteristics of being specifically regulated, are associated with clinical and biological properties, and thus are relevant in breast cancer.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy