Sökning: WFRF:(De Marchi Tommaso) >
Proteogenomic Workf...
Proteogenomic Workflow Reveals Molecular Phenotypes Related to Breast Cancer Mammographic Appearance
-
- De Marchi, Tommaso (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer Proteogenomik,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Biomarkörer och Epi,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breast cancer Proteogenomics,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Biomarkers and epidemiology,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Pyl, Paul Theodor (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer Proteogenomik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Biomarkörer och Epi,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breast cancer Proteogenomics,Lund University Research Groups,Biomarkers and epidemiology,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Sjöström, Martin (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer Proteogenomik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Individuell Bröstcancerbehandling,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröstcancerbehandling,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breast cancer Proteogenomics,Lund University Research Groups,Personalized Breast Cancer Treatment,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast cancer treatment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
visa fler...
-
- Klasson, Stina (författare)
- Skåne University Hospital
-
- Sartor, Hanna (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Diagnostisk radiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Radiology Diagnostics, Malmö,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Skåne University Hospital
-
- Tran, Lena (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröst- och ovarialcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/ovarialcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breast and Ovarian Cancer Genomics,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/ovarian cancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Pekar, Gyula (författare)
- Skåne University Hospital
-
- Malmström, Johan (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Infektionsmedicin,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Infection Medicine Proteomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,SEBRA Sepsis and Bacterial Resistance Alliance,epIgG,Masspektrometri,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,BioMS,Infection Medicine (BMC),Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,Mass Spectrometry,Section V,Department of Clinical Sciences, Lund
-
- Malmström, Lars (författare)
- University of Zurich
-
- Niméus, Emma (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancerkirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Bröstcancer Proteogenomik,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Biomarkörer och Epi,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breast Cancer Surgery,Lund University Research Groups,Breast cancer Proteogenomics,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Biomarkers and epidemiology,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-04-15
- 2021
- Engelska 19 s.
-
Ingår i: Journal of Proteome Research. - : American Chemical Society (ACS). - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 20:5, s. 2983-3001
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://pubs.acs.org...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Proteogenomic approaches have enabled the generat̲ion of novel information levels when compared to single omics studies although burdened by extensive experimental efforts. Here, we improved a data-independent acquisition mass spectrometry proteogenomic workflow to reveal distinct molecular features related to mammographic appearances in breast cancer. Our results reveal splicing processes detectable at the protein level and highlight quantitation and pathway complementarity between RNA and protein data. Furthermore, we confirm previously detected enrichments of molecular pathways associated with estrogen receptor-dependent activity and provide novel evidence of epithelial-to-mesenchymal activity in mammography-detected spiculated tumors. Several transcript-protein pairs displayed radically different abundances depending on the overall clinical properties of the tumor. These results demonstrate that there are differentially regulated protein networks in clinically relevant tumor subgroups, which in turn alter both cancer biology and the abundance of biomarker candidates and drug targets.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
De Marchi, Tomma ...
-
Pyl, Paul Theodo ...
-
Sjöström, Martin
-
Klasson, Stina
-
Sartor, Hanna
-
Tran, Lena
-
visa fler...
-
Pekar, Gyula
-
Malmström, Johan
-
Malmström, Lars
-
Niméus, Emma
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Prote ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet