Sökning: WFRF:(Ek Weronica E) >
A GWAS meta-analysi...
A GWAS meta-analysis from 5 population-based cohorts implicates ion channel genes in the pathogenesis of irritable bowel syndrome
-
- Bonfiglio, F. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Henstrom, M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Nag, A. (författare)
- Kings Coll London, Dept Twin Res & Genet Epidemiol, London, England
-
visa fler...
-
- Hadizadeh, F. (författare)
- Karolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden
-
- Zheng, T. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Cenit, M. C. (författare)
- Univ Med Ctr Groningen, Dept Genet, Groningen, Netherlands
-
- Tigchelaar, E. (författare)
- Univ Med Ctr Groningen, Dept Genet, Groningen, Netherlands
-
- Williams, F. (författare)
- Kings Coll London, Dept Twin Res & Genet Epidemiol, London, England
-
- Reznichenko, A. (författare)
- Karolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden
-
- Ek, Weronica E. (författare)
- Uppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Karolinska Inst, Dept Biosci & Nutr, Stockholm, Sweden
-
- Rivera, N. V. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Homuth, G. (författare)
- Univ Med Greifswald, Interfac Inst Genet & Funct Genom, Dept Funct Gen, Greifswald, Germany
-
- Aghdassi, A. A. (författare)
- Univ Med Greifswald, Dept Med A, Greifswald, Germany
-
- Kacprowski, T. (författare)
- Univ Med Greifswald, Interfac Inst Genet & Funct Genom, Dept Funct Gen, Greifswald, Germany
-
- Mannikko, M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Karhunen, V. (författare)
- Univ Oulu, Ctr Life Course Hlth Res, Oulu, Finland; Oulu Univ Hosp, Oulu, Finland;Imperial Coll London, Dept Epidemiol & Biostat, London, England
-
- Bujanda, L. (författare)
- Biodonostia Hlth Res Inst, Dept Gastrointestinal & Liver Dis, Donostia San Sebastian, Gipuzkoa, Spain; Univ Basque Country, UPV EHU, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, San Sebastian, Spain
-
- Rafter, J. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Wijmenga, C. (författare)
- Univ Med Ctr Groningen, Dept Genet, Groningen, Netherlands
-
- Ronkainen, J. (författare)
- Univ Oulu, Ctr Life Course Hlth Res, Oulu, Finland; Primary Hlth Care Ctr, Tornio, Finland
-
- Hysi, P. (författare)
- Kings Coll London, Dept Ophthalmol, St Thomas Hosp Campus, London, England
-
- Zhernakova, A. (författare)
- Univ Med Ctr Groningen, Dept Genet, Groningen, Netherlands
-
- D'Amato, M. (författare)
- Biodonostia Hlth Res Inst, Dept Gastrointestinal & Liver Dis, Donostia San Sebastian, Gipuzkoa, Spain; Karolinska Inst, Dept Med Solna, Unit Clin Epidemiol, Stockholm, Sweden; BioCruces Hlth Res Inst, Bilbao, Spain; Basque Sci Fdn, IKERBASQUE, Bilbao, Spain
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-04-19
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Neurogastroenterology and Motility. - : WILEY. - 1350-1925 .- 1365-2982. ; 30:9
- Relaterad länk:
-
http://openarchive.k...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- BackgroundIrritable bowel syndrome (IBS) shows genetic predisposition, however, large-scale, powered gene mapping studies are lacking. We sought to exploit existing genetic (genotype) and epidemiological (questionnaire) data from a series of population-based cohorts for IBS genome-wide association studies (GWAS) and their meta-analysis. MethodsBased on questionnaire data compatible with Rome III Criteria, we identified a total of 1335 IBS cases and 9768 asymptomatic individuals from 5 independent European genotyped cohorts. Individual GWAS were carried out with sex-adjusted logistic regression under an additive model, followed by meta-analysis using the inverse variance method. Functional annotation of significant results was obtained via a computational pipeline exploiting ontology and interaction networks, and tissue-specific and gene set enrichment analyses. Key ResultsSuggestive GWAS signals (P5.0x10(-6)) were detected for 7 genomic regions, harboring 64 gene candidates to affect IBS risk via functional or expression changes. Functional annotation of this gene set convincingly (best FDR-corrected P=3.1x10(-10)) highlighted regulation of ion channel activity as the most plausible pathway affecting IBS risk. Conclusion & InferencesOur results confirm the feasibility of population-based studies for gene-discovery efforts in IBS, identify risk genes and loci to be prioritized in independent follow-ups, and pinpoint ion channels as important players and potential therapeutic targets warranting further investigation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Gastroenterologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Gastroenterology and Hepatology (hsv//eng)
Nyckelord
- IBS
- SNP
- genetics
- GWAS
- meta-analysis
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bonfiglio, F.
-
Henstrom, M.
-
Nag, A.
-
Hadizadeh, F.
-
Zheng, T.
-
Cenit, M. C.
-
visa fler...
-
Tigchelaar, E.
-
Williams, F.
-
Reznichenko, A.
-
Ek, Weronica E.
-
Rivera, N. V.
-
Homuth, G.
-
Aghdassi, A. A.
-
Kacprowski, T.
-
Mannikko, M.
-
Karhunen, V.
-
Bujanda, L.
-
Rafter, J.
-
Wijmenga, C.
-
Ronkainen, J.
-
Hysi, P.
-
Zhernakova, A.
-
D'Amato, M.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Gastroenterologi
- Artiklar i publikationen
-
Neurogastroenter ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet