Ancestry-shift refinement mapping of the C6orf97-ESR1 breast cancer susceptibility locus.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-35468" > Ancestry-shift refi...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Ancestry-shift refinement mapping of the C6orf97-ESR1 breast cancer susceptibility locus.

Stacey, Simon N (författare)

Sulem, Patrick (författare)

Zanon, Carlo (författare)

visa fler...

Gudjonsson, Sigurjon A (författare)

Thorleifsson, Gudmar (författare)

Helgason, Agnar (författare)

Jonasdottir, Aslaug (författare)

Besenbacher, Soren (författare)

Kostic, Jelena P (författare)

Fackenthal, James D (författare)

Huo, Dezheng (författare)

Adebamowo, Clement (författare)

Ogundiran, Temidayo (författare)

Olson, Janet E (författare)

Fredericksen, Zachary S (författare)

Wang, Xianshu (författare)

Look, Maxime P (författare)

Sieuwerts, Anieta M (författare): Karolinska Institutet

Martens, John W M (författare)

Pajares, Isabel (författare)

Garcia-Prats, Maria D (författare)

Ramon-Cajal, Jose M (författare)

de Juan, Ana (författare)

Panadero, Angeles (författare)

Ortega, Eugenia (författare)

Hemminki, Kari (författare): Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups

Vermeulen, Sita H (författare)

Asadzadeh, Fatemeh (författare)

van Engelenburg, K C Anton (författare)

Margolin, Sara (författare)

Shen, Chen-Yang (författare)

Wu, Pei-Ei (författare)

Försti, Asta (författare): Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups

Lenner, Per (författare): Umeå universitet,Onkologi

Henriksson, Roger (författare): Umeå universitet,Onkologi

Johansson, Robert (författare): Umeå universitet,Onkologi

Enquist, Kerstin (författare): Umeå universitet,Näringsforskning

Hallmans, Göran (författare): Umeå universitet,Näringsforskning

Jonsson, Thorvaldur (författare)

Sigurdsson, Helgi (författare)

Alexiusdottir, Kristin (författare)

Gudmundsson, Julius (författare)

Sigurdsson, Asgeir (författare)

Frigge, Michael L (författare)

Gudmundsson, Larus (författare)

Kristjansson, Kristleifur (författare)

Halldorsson, Bjarni V (författare)

Styrkarsdottir, Unnur (författare)

Gulcher, Jeffrey R (författare)

Hemminki, Kari (författare)

Lindblom, Annika (författare): Karolinska Institutet

Kiemeney, Lambertus A (författare)

Mayordomo, Jose I (författare)

Foekens, John A (författare)

Couch, Fergus J (författare)

Olopade, Olufunmilayo I (författare)

Gudbjartsson, Daniel F (författare)

Thorsteinsdottir, Unnur (författare)

Rafnar, Thorunn (författare)

Johannsson, Oskar T (författare)

Stefansson, Kari (författare)

visa färre...

(creator_code:org_t)

2010-07-22
2010
Engelska.
Ingår i: PLoS genetics. - : Public Library of Science. - 1553-7404. ; 6:7, s. e1001029-

Relaterad länk:: https://umu.diva-por... (primary) (Raw object); visa fler...; https://journals.plo...; http://dx.doi.org/10... (free); https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; https://lup.lub.lu.s...; http://kipublication...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

We used an approach that we term ancestry-shift refinement mapping to investigate an association, originally discovered in a GWAS of a Chinese population, between rs2046210[T] and breast cancer susceptibility. The locus is on 6q25.1 in proximity to the C6orf97 and estrogen receptor alpha (ESR1) genes. We identified a panel of SNPs that are correlated with rs2046210 in Chinese, but not necessarily so in other ancestral populations, and genotyped them in breast cancer case:control samples of Asian, European, and African origin, a total of 10,176 cases and 13,286 controls. We found that rs2046210[T] does not confer substantial risk of breast cancer in Europeans and Africans (OR = 1.04, P = 0.099, and OR = 0.98, P = 0.77, respectively). Rather, in those ancestries, an association signal arises from a group of less common SNPs typified by rs9397435. The rs9397435[G] allele was found to confer risk of breast cancer in European (OR = 1.15, P = 1.2 x 10(-3)), African (OR = 1.35, P = 0.014), and Asian (OR = 1.23, P = 2.9 x 10(-4)) population samples. Combined over all ancestries, the OR was 1.19 (P = 3.9 x 10(-7)), was without significant heterogeneity between ancestries (P(het) = 0.36) and the SNP fully accounted for the association signal in each ancestry. Haplotypes bearing rs9397435[G] are well tagged by rs2046210[T] only in Asians. The rs9397435[G] allele showed associations with both estrogen receptor positive and estrogen receptor negative breast cancer. Using early-draft data from the 1,000 Genomes project, we found that the risk allele of a novel SNP (rs77275268), which is closely correlated with rs9397435, disrupts a partially methylated CpG sequence within a known CTCF binding site. These studies demonstrate that shifting the analysis among ancestral populations can provide valuable resolution in association mapping.

Hitta via bibliotek

PLoS genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Stacey, Simon N; Sulem, Patrick; Zanon, Carlo; Gudjonsson, Sigu ...; Thorleifsson, Gu ...; Helgason, Agnar; visa fler...; Jonasdottir, Asl ...; Besenbacher, Sor ...; Kostic, Jelena P; Fackenthal, Jame ...; Huo, Dezheng; Adebamowo, Cleme ...; Ogundiran, Temid ...; Olson, Janet E; Fredericksen, Za ...; Wang, Xianshu; Look, Maxime P; Sieuwerts, Aniet ...; Martens, John W ...; Pajares, Isabel; Garcia-Prats, Ma ...; Ramon-Cajal, Jos ...; de Juan, Ana; Panadero, Angele ...; Ortega, Eugenia; Hemminki, Kari; Vermeulen, Sita ...; Asadzadeh, Fatem ...; van Engelenburg, ...; Margolin, Sara; Shen, Chen-Yang; Wu, Pei-Ei; Försti, Asta; Lenner, Per; Henriksson, Roge ...; Johansson, Rober ...; Enquist, Kerstin; Hallmans, Göran; Jonsson, Thorval ...; Sigurdsson, Helg ...; Alexiusdottir, K ...; Gudmundsson, Jul ...; Sigurdsson, Asge ...; Frigge, Michael ...; Gudmundsson, Lar ...; Kristjansson, Kr ...; Halldorsson, Bja ...; Styrkarsdottir, ...; Gulcher, Jeffrey ...; Lindblom, Annika; Kiemeney, Lamber ...; Mayordomo, Jose ...; Foekens, John A; Couch, Fergus J; Olopade, Olufunm ...; Gudbjartsson, Da ...; Thorsteinsdottir ...; Rafnar, Thorunn; Johannsson, Oska ...; Stefansson, Kari; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Hälsovetenskap; och Folkhälsovetensk ...

Artiklar i publikationen: PLoS genetics

Av lärosätet: Umeå universitet; Lunds universitet; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Ancestry-shift refinement mapping of the C6orf97-ESR1 breast cancer susceptibility locus.

Ämnesord

Nyckelord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub