Tyck till om SwePub Sök
här!
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-206444" >
Coding Variants at ...
Coding Variants at Hexa-allelic Amino Acid 13 of HLA-DRB1 Explain Independent SNP Associations with Follicular Lymphoma Risk
-
Foo, Jia Nee (författare)
-
- Smedby, Karin E. (författare)
- Karolinska Institutet
-
Akers, Nicholas K. (författare)
-
visa fler...
-
- Berglund, Mattias (författare)
- Uppsala universitet,Enheten för onkologi
-
Irwan, Ishak D. (författare)
-
Jia, Xiaoming (författare)
-
Li, Yi (författare)
-
Conde, Lucia (författare)
-
- Darabi, Hatef (författare)
- Karolinska Institutet
-
Bracci, Paige M. (författare)
-
Melbye, Mads (författare)
-
- Adami, Hans-Olov (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Glimelius, Bengt (författare)
- Uppsala universitet,Enheten för onkologi
-
Khor, Chiea Chuen (författare)
-
Hjalgrim, Henrik (författare)
-
- Padyukov, Leonid (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Humphreys, Keith (författare)
- Karolinska Institutet
-
Enblad, Gunilla (författare)
-
Skibola, Christine F. (författare)
-
de Bakker, Paul I. W. (författare)
-
Liu, Jianjun (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2013
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: American Journal of Human Genetics. - : Elsevier BV. - 0002-9297 .- 1537-6605. ; 93:1, s. 167-172
- Relaterad länk:
-
http://www.cell.com/...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Non-Hodgkin lymphoma represents a diverse group of blood malignancies, of which follicular lymphoma (FL) is a common subtype. Previous genome-wide association studies (GWASs) have identified in the human leukocyte antigen (HLA) class II region multiple independent SNPs that are significantly associated with FL risk. To dissect these signals and determine whether coding variants in HLA genes are responsible for the associations, we conducted imputation, HLA typing, and sequencing in three independent populations for a total of 689 cases and 2,446 controls. We identified a hexa-allelic amino acid polymorphism at position 13 of the HLA-DR beta chain that showed the strongest association with FL within the major histocompatibility complex (MHC) region (multiallelic p = 2.3 x 10(-15)). Out of six possible amino acids that occurred at that position within the population, we classified two as high risk (Tyr and Phe), two as low risk (Ser and Arg), and two as moderate risk (His and Gly). There was a 4.2-fold difference in risk (95% confidence interval = 2.9-6.1) between subjects carrying two alleles encoding high-risk amino acids and those carrying two alleles encoding low-risk amino acids (p = 1.01 x 10(-14)). This coding variant might explain the complex SNP associations identified by GWASs and suggests a common HLA-DR antigen-driven mechanism for the pathogenesis of FL and rheumatoid arthritis.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Foo, Jia Nee
-
Smedby, Karin E.
-
Akers, Nicholas ...
-
Berglund, Mattia ...
-
Irwan, Ishak D.
-
Jia, Xiaoming
-
visa fler...
-
Li, Yi
-
Conde, Lucia
-
Darabi, Hatef
-
Bracci, Paige M.
-
Melbye, Mads
-
Adami, Hans-Olov
-
Glimelius, Bengt
-
Khor, Chiea Chue ...
-
Hjalgrim, Henrik
-
Padyukov, Leonid
-
Humphreys, Keith
-
Enblad, Gunilla
-
Skibola, Christi ...
-
de Bakker, Paul ...
-
Liu, Jianjun
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
American Journal ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet