A genome-wide association study of IgM antibody against phosphorylcholine: shared genetics and phenotypic relationship to chronic lymphocytic leukemia

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/267992" > A genome-wide assoc...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

A genome-wide association study of IgM antibody against phosphorylcholine: shared genetics and phenotypic relationship to chronic lymphocytic leukemia

Chen, X. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Gustafsson, Stefan (författare): Uppsala University,Uppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab

Whitington, T. (författare): Karolinska Institute

visa fler...

Borné, Yan (författare): Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Lorentzen, Erik, 1974 (författare): University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Bioinformatics,Core Facilities, Bioinformatics,Gothenburg Univ, Dept Bioinformat, Gothenburg, Sweden

Sun, J. (författare): Karolinska Institute

Almgren, Peter (författare): Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Su, J. (författare)

Karlsson, R. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Song, J. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Lu, Y. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet,QIMR Berghofer Medical Research Institute

Zhan, Y. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Hagg, S. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Svensson, P. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet,Stockholm South General Hospital

Smedby, K. E. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Lind, Lars (författare): Karolinska Institute,Uppsala University,Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Kardiovaskulär epidemiologi,Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Nobels Vag 12A,POB 281, SE-17177 Stockholm, Sweden,Mayo Clinic Minnesota

Ingelsson, Erik, 1975- (författare): Uppsala University,Uppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stanford Univ, Dept Med, Sch Med, Div Cardiovasc Med,Cardiovasc Inst, Stanford, CA 94305 USA,Stanford University

Lindgren, C. M. (författare): Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England;Broad Inst MIT & Harvard Univ, Cambridge, MA USA,Wellcome Trust Centre for Human Genetics,Broad Institute

Morris, A. P. (författare): Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England;Univ Liverpool, Dept Biostat, Liverpool, Merseyside, England,Wellcome Trust Centre for Human Genetics,University of Liverpool

Melander, Olle (författare): Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Karlsson, Thomas, 1956 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för samhällsmedicin och folkhälsa, enheten för hälsometri,Institute of Medicine, Department of Public Health and Community Medicine, Health Metrics,Gothenburg Univ, Sahlgrenska Acad, Inst Med, Hlth Metr, Gothenburg, Sweden,Sahlgrenska Academy

de Faire, U. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Caidahl, Kenneth, 1949 (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Gothenburg Univ, Sahlgrenska Acad, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden;Karolinska Inst, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden,Sahlgrenska Academy

Engström, Gunnar (författare): Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine

Lind, L. (författare)

Karlsson, M. C. I. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

Pedersen, N. L. (författare)

Frostegard, J. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet,Karolinska University Hospital

Magnusson, P. K. E. (författare): Karolinska Institute,Karolinska Institutet

visa färre...

(creator_code:org_t)

2018-03-14
2018
Engelska.
Ingår i: Human Molecular Genetics. - : Oxford University Press (OUP). - 0964-6906 .- 1460-2083. ; 27:10, s. 1809-1818

Relaterad länk:: https://academic.oup...; visa fler...; http://dx.doi.org/10...; https://gup.ub.gu.se...; https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; http://kipublication...; https://lup.lub.lu.s...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

Phosphorylcholine (PC) is an epitope on oxidized low-density lipoprotein (oxLDL), apoptotic cells and several pathogens like Streptococcus pneumoniae. Immunoglobulin M against PC (IgM anti-PC) has the ability to inhibit uptake of oxLDL by macrophages and increase clearance of apoptotic cells. From our genome-wide association studies (GWASs) in four European-ancestry cohorts, six single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 11q24.1 were discovered (in 3002 individuals) and replicated (in 646 individuals) to be associated with serum level of IgM anti-PC (the leading SNP rs35923643-G, combined beta = 0.19, 95% confidence interval 0.13-0.24, P = 4.3 x 10-11). The haplotype tagged by rs35923643-G (or its proxy SNP rs735665-A) is also known as the top risk allele for chronic lymphocytic leukemia (CLL), and a main increasing allele for general IgM. By using summary GWAS results of IgM anti-PC and CLL in the polygenic risk score (PRS) analysis, PRS on the basis of IgM anti-PC risk alleles positively associated with CLL risk (explained 0.6% of CLL variance, P = 1.2 x 10-15). Functional prediction suggested that rs35923643-G might impede the binding of Runt-related transcription factor 3, a tumor suppressor playing a central role in the immune regulation of cancers. Contrary to the expectations from the shared genetics between IgM anti-PC and CLL, an inverse relationship at the phenotypic level was found in a nested case-control study (30 CLL cases with 90 age- and sex-matched controls), potentially reflecting reverse causation. The suggested function of the top variant as well as the phenotypic association between IgM anti-PC and CLL risk needs replication and motivates further studies.

Hitta via bibliotek

Human Molecular Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: Human Molecular ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet; Uppsala universitet; Karolinska Institutet; Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

A genome-wide association study of IgM antibody against phosphorylcholine: shared genetics and phenotypic relationship to chronic lymphocytic leukemia

Ämnesord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub