Tyck till om SwePub Sök här!
onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:136487070"
Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:136487070" > FANTOM5 CAGE profil...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
FANTOM5 CAGE profiles of human and mouse samples
- Noguchi, S (författare)
- Arakawa, T (författare)
- Fukuda, S (författare)
- visa fler...
- Furuno, M (författare)
- Hasegawa, A (författare)
- Hori, F (författare)
- Ishikawa-Kato, S (författare)
- Kaida, K (författare)
- Kaiho, A (författare)
- Kanamori-Katayama, M (författare)
- Kawashima, T (författare)
- Kojima, M (författare)
- Kubosaki, A (författare)
- Manabe, RI (författare)
- Murata, M (författare)
- Nagao-Sato, S (författare)
- Nakazato, K (författare)
- Ninomiya, N (författare)
- Nishiyori-Sueki, H (författare)
- Noma, S (författare)
- Saijyo, E (författare)
- Saka, A (författare)
- Sakai, M (författare)
- Simon, C (författare)
- Suzuki, N (författare)
- Tagami, M (författare)
- Watanabe, S (författare)
- Yoshida, S (författare)
- Axton, RA (författare)
- Babina, M (författare)
- Baillie, JK (författare)
- Barnett, TC (författare)
- Beckhouse, AG (författare)
- Blumenthal, A (författare)
- Bodega, B (författare)
- Bonetti, A (författare)
- Briggs, J (författare)
- Brombacher, F (författare)
- Carlisle, AJ (författare)
- Clevers, HC (författare)
- Davis, CA (författare)
- Detmar, M (författare)
- Dohi, T (författare)
- Edge, ASB (författare)
- Edinger, M (författare)
- Ehrlund, A (författare)
- Endoh, M (författare)
- Enomoto, H (författare)
- Eslami, A (författare)
- Fagiolini, M (författare)
- Fairbairn, L (författare)
- Farach-Carson, MC (författare)
- Faulkner, GJ (författare)
- Ferrai, C (författare)
- Fisher, ME (författare)
- Forrester, LM (författare)
- Fujita, R (författare)
- Furusawa, J (författare)
- Geijtenbeek, TB (författare)
- Gingeras, T (författare)
- Goldowitz, D (författare)
- Guhl, S (författare)
- Guler, R (författare)
- Gustincich, S (författare)
- Ha, TJ (författare)
- Hamaguchi, M (författare)
- Hara, M (författare)
- Hasegawa, Y (författare)
- Herlyn, M (författare)
- Heutink, P (författare)
- Hitchens, KJ (författare)
- Hume, DA (författare)
- Ikawa, T (författare)
- Ishizu, Y (författare)
- Kai, C (författare)
- Kawamoto, H (författare)
- Kawamura, YI (författare)
- Kempfle, JS (författare)
- Kenna, TJ (författare)
- Khachigian, LM (författare)
- Kitamura, T (författare)
- Klein, S (författare)
- Klinken, SP (författare)
- Knox, AJ (författare)
- Kojima, S (författare)
- Koseki, H (författare)
- Koyasu, S (författare)
- Lee, W (författare)
- Mackay-sim, A (författare)
- Mizuno, Y (författare)
- Morikawa, H (författare)
- Morimoto, M (författare)
- Moro, K (författare)
- Morris, KJ (författare)
- Motohashi, H (författare)
- Mummery, CL (författare)
- Nakachi, Y (författare)
- Nakahara, F (författare)
- Nakamura, T (författare)
- Nakamura, Y (författare)
- Nozaki, T (författare)
- Ogishima, S (författare)
- Ohkura, N (författare)
- Ohno, H (författare)
- Ohshima, M (författare)
- Okada-Hatakeyama, M (författare)
- Okazaki, Y (författare)
- Orlando, V (författare)
- Ovchinnikov, DA (författare)
- Passier, R (författare)
- Patrikakis, M (författare)
- Pombo, A (författare)
- Pradhan-Bhatt, S (författare)
- Qin, XY (författare)
- Rehli, M (författare)
- Rizzu, P (författare)
- Roy, S (författare)
- Sajantila, A (författare)
- Sakaguchi, S (författare)
- Sato, H (författare)
- Satoh, H (författare)
- Savvi, S (författare)
- Saxena, A (författare)
- Schmidl, C (författare)
- Schneider, C (författare)
- Schulze-Tanzil, GG (författare)
- Schwegmann, A (författare)
- Sheng, GJ (författare)
- Shin, JW (författare)
- Sugiyama, D (författare)
- Sugiyama, T (författare)
- Summers, KM (författare)
- Takahashi, N (författare)
- Takai, J (författare)
- Tanaka, H (författare)
- Tatsukawa, H (författare)
- Tomoiu, A (författare)
- Toyoda, H (författare)
- van de Wetering, M (författare)
- van den Berg, LM (författare)
- Verardo, R (författare)
- Vijayan, D (författare)
- Wells, CA (författare)
- Winteringham, LN (författare)
- Wolvetang, E (författare)
- Yamaguchi, Y (författare)
- Yamamoto, M (författare)
- Yanagi-Mizuochi, C (författare)
- Yoneda, M (författare)
- Yonekura, Y (författare)
- Zhang, PG (författare)
- Zucchelli, S (författare)
- Abugessaisa, I (författare)
- Arner, E (författare)
- Harshbarger, J (författare)
- Kondo, A (författare)
- Lassmann, T (författare)
- Lizio, M (författare)
- Sahin, S (författare)
- Sengstag, T (författare)
- Severin, J (författare)
- Shimoji, H (författare)
- Suzuki, M (författare)
- Suzuki, H (författare)
- Kawai, J (författare)
- Kondo, N (författare)
- Itoh, M (författare)
- Daub, CO (författare)
- Kasukawa, T (författare)
- Kawaji, H (författare)
- Carninci, P (författare)
- Forrest, ARR (författare)
- Hayashizaki, Y (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2017-08-29
- 2017
- Engelska.
- Ingår i: Scientific data. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2052-4463. ; 4, s. 170112-
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In the FANTOM5 project, transcription initiation events across the human and mouse genomes were mapped at a single base-pair resolution and their frequencies were monitored by CAGE (Cap Analysis of Gene Expression) coupled with single-molecule sequencing. Approximately three thousands of samples, consisting of a variety of primary cells, tissues, cell lines, and time series samples during cell activation and development, were subjected to a uniform pipeline of CAGE data production. The analysis pipeline started by measuring RNA extracts to assess their quality, and continued to CAGE library production by using a robotic or a manual workflow, single molecule sequencing, and computational processing to generate frequencies of transcription initiation. Resulting data represents the consequence of transcriptional regulation in each analyzed state of mammalian cells. Non-overlapping peaks over the CAGE profiles, approximately 200,000 and 150,000 peaks for the human and mouse genomes, were identified and annotated to provide precise location of known promoters as well as novel ones, and to quantify their activities.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Noguchi, S
- Arakawa, T
- Fukuda, S
- Furuno, M
- Hasegawa, A
- Hori, F
- visa fler...
- Ishikawa-Kato, S
- Kaida, K
- Kaiho, A
- Kanamori-Katayam ...
- Kawashima, T
- Kojima, M
- Kubosaki, A
- Manabe, RI
- Murata, M
- Nagao-Sato, S
- Nakazato, K
- Ninomiya, N
- Nishiyori-Sueki, ...
- Noma, S
- Saijyo, E
- Saka, A
- Sakai, M
- Simon, C
- Suzuki, N
- Tagami, M
- Watanabe, S
- Yoshida, S
- Arner, P
- Axton, RA
- Babina, M
- Baillie, JK
- Barnett, TC
- Beckhouse, AG
- Blumenthal, A
- Bodega, B
- Bonetti, A
- Briggs, J
- Brombacher, F
- Carlisle, AJ
- Clevers, HC
- Davis, CA
- Detmar, M
- Dohi, T
- Edge, ASB
- Edinger, M
- Ehrlund, A
- Ekwall, K
- Endoh, M
- Enomoto, H
- Eslami, A
- Fagiolini, M
- Fairbairn, L
- Farach-Carson, M ...
- Faulkner, GJ
- Ferrai, C
- Fisher, ME
- Forrester, LM
- Fujita, R
- Furusawa, J
- Geijtenbeek, TB
- Gingeras, T
- Goldowitz, D
- Guhl, S
- Guler, R
- Gustincich, S
- Ha, TJ
- Hamaguchi, M
- Hara, M
- Hasegawa, Y
- Herlyn, M
- Heutink, P
- Hitchens, KJ
- Hume, DA
- Ikawa, T
- Ishizu, Y
- Kai, C
- Kawamoto, H
- Kawamura, YI
- Kempfle, JS
- Kenna, TJ
- Kere, J
- Khachigian, LM
- Kitamura, T
- Klein, S
- Klinken, SP
- Knox, AJ
- Kojima, S
- Koseki, H
- Koyasu, S
- Lee, W
- Lennartsson, A
- Mackay-sim, A
- Mejhert, N
- Mizuno, Y
- Morikawa, H
- Morimoto, M
- Moro, K
- Morris, KJ
- Motohashi, H
- Mummery, CL
- Nakachi, Y
- Nakahara, F
- Nakamura, T
- Nakamura, Y
- Nozaki, T
- Ogishima, S
- Ohkura, N
- Ohno, H
- Ohshima, M
- Okada-Hatakeyama ...
- Okazaki, Y
- Orlando, V
- Ovchinnikov, DA
- Passier, R
- Patrikakis, M
- Pombo, A
- Pradhan-Bhatt, S
- Qin, XY
- Rehli, M
- Rizzu, P
- Roy, S
- Sajantila, A
- Sakaguchi, S
- Sato, H
- Satoh, H
- Savvi, S
- Saxena, A
- Schmidl, C
- Schneider, C
- Schulze-Tanzil, ...
- Schwegmann, A
- Sheng, GJ
- Shin, JW
- Sugiyama, D
- Sugiyama, T
- Summers, KM
- Takahashi, N
- Takai, J
- Tanaka, H
- Tatsukawa, H
- Tomoiu, A
- Toyoda, H
- van de Wetering, ...
- van den Berg, LM
- Verardo, R
- Vijayan, D
- Wells, CA
- Winteringham, LN
- Wolvetang, E
- Yamaguchi, Y
- Yamamoto, M
- Yanagi-Mizuochi, ...
- Yoneda, M
- Yonekura, Y
- Zhang, PG
- Zucchelli, S
- Abugessaisa, I
- Arner, E
- Harshbarger, J
- Kondo, A
- Lassmann, T
- Lizio, M
- Sahin, S
- Sengstag, T
- Severin, J
- Shimoji, H
- Suzuki, M
- Suzuki, H
- Kawai, J
- Kondo, N
- Itoh, M
- Daub, CO
- Kasukawa, T
- Kawaji, H
- Carninci, P
- Forrest, ARR
- Hayashizaki, Y
- visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
- Scientific data
- Av lärosätet
- Karolinska Institutet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
